Reduction of Paraoxonase expression followed by inactivation across independent semiaquatic mammals suggests stepwise path to pseudogenization
Rattachement africain : us, ca. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
ABSTRACT Convergent adaptation to the same environment by multiple lineages frequently involves rapid evolutionary change at the same genes, implicating these genes as important for environmental adaptation. Such adaptive molecular changes may yield either change or loss of protein function; loss of function can eliminate newly deleterious proteins or reduce energy necessary for protein production. We previously found a striking case of recurrent pseudogenization of the Paraoxonase 1 ( Pon1 ) gene among aquatic mammal lineages - Pon1 became a pseudogene with genetic lesions, such as stop codons and frameshifts, at least four times independently in aquatic and semiaquatic mammals. Here, we assess the landscape and pace of pseudogenization by studying Pon1 sequences, expression levels, and enzymatic activity across four aquatic and semiaquatic mammal lineages: pinnipeds, cetaceans, otters, and beavers. We observe in beavers and pinnipeds an unexpected reduction in expression of Pon3 , a paralog with similar expression patterns but different substrate preferences. Ultimately, in all lineages with aquatic/semiaquatic members, we find that preceding any coding level pseudogenization events in Pon1 , there is a drastic decrease in expression, followed by relaxed selection, thus allowing accumulation of disrupting mutations. The recurrent loss of Pon1 function in aquatic/semiaquatic lineages is consistent with a benefit to Pon1 functional loss in aquatic environments. Accordingly, we examine diving and dietary traits across pinniped species as potential driving forces of Pon1 functional loss. We find that loss is best correlated with diving activity and likely results from changes in selective pressures associated with hypoxia and hypoxia-induced inflammation.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.
- Titre Crossref
- Reduction of <i>Paraoxonase</i> expression followed by inactivation across independent semiaquatic mammals suggests stepwise path to pseudogenization
- Date Crossref
- 03/10/2022
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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University of Utah Department of Human Genetics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Toronto Department of Biological Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Scarborough Health Network pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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University of Toronto Scarborough pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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The University of Texas at San Antonio pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Tufts University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Jackson Laboratory pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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University of Washington Medical Center Department of Medicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Sonoma State University Department of Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Alaska Fairbanks pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Washington Department of Environmental & Occupational Health Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Lehigh University Department of Biological Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Department of Human Genetics — University of Utah, Department of Biological Sciences — University of Toronto et Scarborough Health Network, avec 9 autres affiliations.
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