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Accès ouvert déclaré 2022 article

Structural basis of 3′-end poly(A) RNA recognition by LARP1

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4Institutions déclarées
2Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : ca, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

La-related proteins (LARPs) comprise a family of RNA-binding proteins involved in a wide range of posttranscriptional regulatory activities. LARPs share a unique tandem of two RNA-binding domains, La motif (LaM) and RNA recognition motif (RRM), together referred to as a La-module, but vary in member-specific regions. Prior structural studies of La-modules reveal they are pliable platforms for RNA recognition in diverse contexts. Here, we characterize the La-module of LARP1, which plays an important role in regulating synthesis of ribosomal proteins in response to mTOR signaling and mRNA stabilization. LARP1 has been well characterized functionally but no structural information exists for its La-module. We show that unlike other LARPs, the La-module in LARP1 does not contain an RRM domain. The LaM alone is sufficient for binding poly(A) RNA with submicromolar affinity and specificity. Multiple high-resolution crystal structures of the LARP1 LaM domain in complex with poly(A) show that it is highly specific for the RNA 3'-end, and identify LaM residues Q333, Y336 and F348 as the most critical for binding. Use of a quantitative mRNA stabilization assay and poly(A) tail-sequencing demonstrate functional relevance of LARP1 RNA binding in cells and provide novel insight into its poly(A) 3' protection activity.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Structural basis of 3′-end poly(A) RNA recognition by LARP1
Date Crossref
18/08/2022
Éditeur
Oxford University Press (OUP)
Type
journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • McGill University Centre de recherche en biologie structurale pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • National Institutes of Health pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development Intramural Research Program pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Concordia University Department of Chemistry and Biochemistry pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure

Centre de recherche en biologie structurale — McGill University, National Institutes of Health et Intramural Research Program — Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development, avec 1 autre affiliation.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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