Comparative parallel multi-omics analysis during the induction of pluripotent and trophectoderm states
Rattachement africain : il, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Following fertilization, it is only at the 32-64-cell stage when a clear segregation between cells of the inner cell mass and trophectoderm is observed, suggesting a 'T'-shaped model of specification. Here, we examine whether the acquisition of these two states in vitro, by nuclear reprogramming, share similar dynamics/trajectories. Using a comparative parallel multi-omics analysis (i.e., bulk RNA-seq, scRNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, RRBS and CNVs) on cells undergoing reprogramming to pluripotency and TSC state we show that each reprogramming system exhibits specific trajectories from the onset of the process, suggesting 'V'-shaped model. We describe in detail the various trajectories toward the two states and illuminate reprogramming stage-specific markers, blockers, facilitators and TSC subpopulations. Finally, we show that while the acquisition of the TSC state involves the silencing of embryonic programs by DNA methylation, during the acquisition of pluripotency these regions are initially defined but retain inactive by the elimination of H3K27ac.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Comparative parallel multi-omics analysis during the induction of pluripotent and trophectoderm states
- Date Crossref
- 17/06/2022
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Hebrew University of Jerusalem pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
German Cancer Research Center German Cancer Research Consortium (DKTK) pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Heidelberg University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Deutsches Konsortium für Translationale Krebsforschung pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Hadassah Medical Center pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
The Hebrew University-Hadassah Medical School Department of Developmental Biology and Cancer Research pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
School of Computer Science and Engineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
German Cancer Consortium (DKTK) pays non établi dans la noticeInstitution
-
Group Genome Instability in Tumors pays non établi dans la noticeInstitution
Hebrew University of Jerusalem, German Cancer Research Consortium (DKTK) — German Cancer Research Center et Heidelberg University, avec 6 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.