HIV- 1 lentivirus tethering to the genome is associated with transcription factor binding sites found in genes that favour virus survival
Rattachement africain : gb, de, us, Afrique du Sud. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Lentiviral vectors (LV) are attractive for permanent and effective gene therapy. However, integration into the host genome can cause insertional mutagenesis highlighting the importance of understanding of LV integration. Insertion site (IS) tethering is believed to involve cellular proteins such as PSIP1/LEDGF/p75, which binds to the virus pre-integration complexes (PICs) helping to target the virus genome. Transcription factors (TF) that bind both the vector LTR and host genome are also suspected influential to this. To determine the role of TF in the tethering process, we mapped predicted transcription factor binding sites (pTFBS) near to IS chosen by HIV-1 LV using a narrow 20 bp window in infected human induced pluripotent stem cells (iPSCs) and their hepatocyte-like cell (HLC) derivatives. We then aligned the pTFBS with these sequences found in the LTRs of native and self-inactivated LTRs. We found significant enrichment of these sequences for pTFBS essential to HIV-1 life cycle and virus survival. These same sites also appear in HIV-1 patient IS and in mice infected with HIV-1 based LV. This in silco data analysis suggests pTFBS present in the virus LTR and IS sites selected by HIV-1 LV are important to virus survival and propagation.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- HIV- 1 lentivirus tethering to the genome is associated with transcription factor binding sites found in genes that favour virus survival
- Date Crossref
- 05/05/2022
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Brunel University of London pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Heidelberg University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
University Hospital Heidelberg pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
Gene Bridges (Germany) pays non établi dans la noticeEntreprise
-
MRC Centre for Regenerative Medicine pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
University of Edinburgh Centre for Regenerative Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
University College London Division of Infection and Immunity pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
National Institute for Biological Standards and Control Division of Advanced Therapies pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
University of the Witwatersrand University of the Witwatersrand, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
-
National Institute for Health and Care Research pays non établi dans la noticeOrganisme public
-
National Center for Tumor Diseases pays non établi dans la noticeOrganisme public
-
Imperial College London Department of Life Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Brunel University of London, Heidelberg University et University Hospital Heidelberg, avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Afrique du Sud.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.