Accès ouvert déclaré 2022 article

Fusobacterium nucleatum is associated with inflammation and poor survival in early-stage HPV-negative tongue cancer

Sanket Desai, Bhasker Dharavath, Sujith Manavalan, Aishwarya Rane, Archana Kumari Redhu, Roma Sunder, Ashwin B. Butle, Rohit Mishra, Asim Joshi, Trupti Togar, Shruti Apte, Pratyusha Bala, Pratik Chandrani, Supriya Chopra, Murali Dharan Bashyam, Anirban Banerjee, Kumar Prabhash, Sudhir Vasudevan Nair, Amit Dutt

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Le résumé fourni par la source

Abstract Persistent pathogen infection is a known cause of malignancy, although with sparse systematic evaluation across tumor types. We present a comprehensive landscape of 1060 infectious pathogens across 239 whole exomes and 1168 transcriptomes of breast, lung, gallbladder, cervical, colorectal, and head and neck tumors. We identify known cancer-associated pathogens consistent with the literature. In addition, we identify a significant prevalence of Fusobacterium in head and neck tumors, comparable to colorectal tumors. The Fusobacterium-high subgroup of head and neck tumors occurs mutually exclusive to human papillomavirus, and is characterized by overexpression of miRNAs associated with inflammation, elevated innate immune cell fraction and nodal metastases. We validate the association of Fusobacterium with the inflammatory markers IL1B, IL6 and IL8, miRNAs hsa-mir-451a, hsa-mir-675 and hsa-mir-486-1, and MMP10 in the tongue tumor samples. A higher burden of Fusobacterium is also associated with poor survival, nodal metastases and extracapsular spread in tongue tumors defining a distinct subgroup of head and neck cancer.

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Titre Crossref: <i>Fusobacterium nucleatum</i> is associated with inflammation and poor survival in early-stage HPV-negative tongue cancer
Date Crossref: 13/01/2022
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
Type: journal-article

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Indian Institute of Technology Bombay Department of Biosciences and Bioengineering pays non établi dans la notice
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Structure de recherche
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Homi Bhabha National Institute, Advanced Centre for Treatment et Department of Biosciences and Bioengineering — Indian Institute of Technology Bombay, avec 6 autres affiliations.

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