Fast and accurate protein structure search with Foldseek
Rattachement africain : de, kr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
As structure prediction methods are generating millions of publicly available protein structures, searching these databases is becoming a bottleneck. Foldseek aligns the structure of a query protein against a database by describing the amino acid backbone of proteins as sequences over a structural alphabet. Foldseek decreases computation times by four to five orders of magnitude with 86%, 88% and 133% of the sensitivities of DALI, TM-align and CE, respectively.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Fast and accurate protein structure search with Foldseek
- Date Crossref
- 09/02/2022
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Les institutions déclarées
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