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Accès ouvert déclaré 2022 preprint

Fast and accurate protein structure search with Foldseek

380Citations signalées, ce qui n’est pas une note de qualité
4Institutions déclarées
2Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : de, kr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

As structure prediction methods are generating millions of publicly available protein structures, searching these databases is becoming a bottleneck. Foldseek aligns the structure of a query protein against a database by describing the amino acid backbone of proteins as sequences over a structural alphabet. Foldseek decreases computation times by four to five orders of magnitude with 86%, 88% and 133% of the sensitivities of DALI, TM-align and CE, respectively.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Fast and accurate protein structure search with Foldseek
Date Crossref
09/02/2022
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Les institutions déclarées

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

Protein Structure and DynamicsMachine Learning in BioinformaticsRNA and protein synthesis mechanisms

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