Network medicine for disease module identification and drug repurposing with the NeDRex platform
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Le résumé fourni par la source
Traditional drug discovery faces a severe efficacy crisis. Repurposing of registered drugs provides an alternative with lower costs and faster drug development timelines. However, the data necessary for the identification of disease modules, i.e. pathways and sub-networks describing the mechanisms of complex diseases which contain potential drug targets, are scattered across independent databases. Moreover, existing studies are limited to predictions for specific diseases or non-translational algorithmic approaches. There is an unmet need for adaptable tools allowing biomedical researchers to employ network-based drug repurposing approaches for their individual use cases. We close this gap with NeDRex, an integrative and interactive platform for network-based drug repurposing and disease module discovery. NeDRex integrates ten different data sources covering genes, drugs, drug targets, disease annotations, and their relationships. NeDRex allows for constructing heterogeneous biological networks, mining them for disease modules, prioritizing drugs targeting disease mechanisms, and statistical validation. We demonstrate the utility of NeDRex in five specific use-cases.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Network medicine for disease module identification and drug repurposing with the NeDRex platform
- Date Crossref
- 25/11/2021
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Universität Hamburg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Technical University of Munich pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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HAW Hamburg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Newcastle University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Medizinische Hochschule Hannover pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Technische Universität Braunschweig Division Data Science in Biomedicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Universidad Autónoma Metropolitana pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Maastricht University Department of Pharmacology and Personalised Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Essen University Hospital pays non établi dans la noticeOrganisme public
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University of Southern Denmark Computational Biomedicine Lab pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Hamburg Chair of Computational Systems Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Universität Hamburg, Technical University of Munich et HAW Hamburg, avec 9 autres affiliations.
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