Integrative Omics Analysis Unravels Microvascular Inflammation-Related Pathways in Kidney Allograft Biopsies
Rattachement africain : fr, be, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
In solid-organ transplantation, microRNAs (miRNAs) have emerged as key players in the regulation of allograft cells function in response to injury. To gain insight into the role of miRNAs in antibody-mediated rejection, a rejection phenotype histologically defined by microvascular inflammation, kidney allograft biopsies were subjected to miRNA but also messenger RNA (mRNA) profiling. Using a unique multistep selection process specific to the BIOMARGIN study (discovery cohort, N=86; selection cohort, N=99; validation cohort, N=298), six differentially expressed miRNAs were consistently identified: miR-139-5p (down) and miR-142-3p/150-5p/155-5p/222-3p/223-3p (up). Their expression level gradually correlated with microvascular inflammation intensity. The cell specificity of miRNAs target genes was investigated by integrating their in vivo mRNA targets with single-cell RNA sequencing from an independent allograft biopsy cohort. Endothelial-derived miR-139-5p expression correlated negatively with MHC-related genes expression. Conversely, epithelial-derived miR-222-3p overexpression was strongly associated with degraded renal electrolyte homeostasis and repressed immune-related pathways. In immune cells, miR-150-5p regulated NF-κB activation in T lymphocytes whereas miR-155-5p regulated mRNA splicing in antigen-presenting cells. Altogether, integrated omics enabled us to unravel new pathways involved in microvascular inflammation and suggests that metabolism modifications in tubular epithelial cells occur as a consequence of antibody-mediated rejection, beyond the nearby endothelial compartment.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Integrative Omics Analysis Unravels Microvascular Inflammation-Related Pathways in Kidney Allograft Biopsies
- Date Crossref
- 02/11/2021
- Éditeur
- Frontiers Media SA
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Inserm pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Université Paris Cité pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institut Necker Enfants Malades pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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KU Leuven pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Assistance Publique – Hôpitaux de Paris pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Medizinische Hochschule Hannover pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université de Limoges pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Katholieke Universiteit (KU) Leuven Department of Microbiology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université de Paris Necker-Enfants Malades Institute pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University Hospitals Leuven Department of Nephrology and Kidney Transplantation pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Necker Hospital Department of Nephrology and Kidney Transplantation pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Department of Nephrology pays non établi dans la noticeInstitution
Inserm, Université Paris Cité et Institut Necker Enfants Malades, avec 9 autres affiliations.
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