Co-evolutionary Signals IdentifyBurkholderia pseudomalleiSurvival Strategies in a Hostile Environment
Rattachement africain : th, gb, fi, no. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The soil bacterium Burkholderia pseudomallei is the causative agent of melioidosis and a significant cause of human morbidity and mortality in many tropical and subtropical countries. The species notoriously survives harsh environmental conditions but the genetic architecture for these adaptations remains unclear. Here we employed a powerful combination of genome-wide epistasis and co-selection studies (2,011 genomes), condition-wide transcriptome analyses (82 diverse conditions), and a gene knockout assay to uncover signals of "co-selection"-that is a combination of genetic markers that have been repeatedly selected together through B. pseudomallei evolution. These enabled us to identify 13,061 mutation pairs under co-selection in distinct genes and noncoding RNA. Genes under co-selection displayed marked expression correlation when B. pseudomallei was subjected to physical stress conditions, highlighting the conditions as one of the major evolutionary driving forces for this bacterium. We identified a putative adhesin (BPSL1661) as a hub of co-selection signals, experimentally confirmed a BPSL1661 role under nutrient deprivation, and explored the functional basis of co-selection gene network surrounding BPSL1661 in facilitating the bacterial survival under nutrient depletion. Our findings suggest that nutrient-limited conditions have been the common selection pressure acting on this species, and allelic variation of BPSL1661 may have promoted B. pseudomallei survival during harsh environmental conditions by facilitating bacterial adherence to different surfaces, cells, or living hosts.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- Co-evolutionary Signals Identify<i>Burkholderia pseudomallei</i>Survival Strategies in a Hostile Environment
- Date Crossref
- 18/10/2021
- Éditeur
- Oxford University Press (OUP)
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Mahidol University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Wellcome Sanger Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Mahidol Oxford Tropical Medicine Research Unit pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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King Mongkut's University of Technology Thonburi Bioinformatics & Systems Biology Program pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Helsinki Department of Mathematics and Statistics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Oslo Department of Mathematics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Helsinki Institute for Information Technology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Khon Kaen University Melioidosis Research Center pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Oslo University Hospital Oslo Centre for Biostatistics and Epidemiology pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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University of Bath Department of Biology and Biochemistry pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Oxford Centre for Tropical Medicine and Global Health pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Cambridge Department of Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Mahidol University, Wellcome Sanger Institute et Mahidol Oxford Tropical Medicine Research Unit, avec 9 autres affiliations.
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