Expansion of a SARS-CoV-2 Delta variant with an 872 nt deletion encompassing ORF7a, ORF7b and ORF8, Poland, July to August 2021
Rattachement africain : pl. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Routine genomic surveillance on samples from COVID-19 patients collected in Poland during summer 2021 revealed the emergence of a SARS-CoV-2 Delta variant with a large 872 nt deletion. This change, confirmed by Sanger and deep sequencing, causes complete loss of ORF7a, ORF7b, and ORF8 genes. The index case carrying the deletion is unknown. The standard pipeline for sequencing may mask this deletion with a long stretch of N’s. Effects of this deletion on phenotype or immune evasion needs further study.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Expansion of a SARS-CoV-2 Delta variant with an 872 nt deletion encompassing ORF7a, ORF7b and ORF8, Poland, July to August 2021
- Date Crossref
- 30/09/2021
- Éditeur
- European Centre for Disease Control and Prevention (ECDC)
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Jagiellonian University Virogenetics Laboratory of Virology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Gdańsk Medical University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Intercollegiate Faculty of Biotechnology of University of Gdansk and Medical University of Gdansk Laboratory of Recombinant Vaccines pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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genXone SA pays non établi dans la noticeEntreprise
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Diagnostyka Medical Laboratories pays non établi dans la noticeInstitution
Virogenetics Laboratory of Virology — Jagiellonian University, Gdańsk Medical University et Laboratory of Recombinant Vaccines — Intercollegiate Faculty of Biotechnology of University of Gdansk and Medical University of Gdansk, avec 2 autres affiliations.
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