Interbase-FRET binding assay for pre-microRNAs
Rattachement africain : se. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The aberrant expression of microRNAs (miRs) has been linked to several human diseases. A promising approach for targeting these anomalies is the use of small-molecule inhibitors of miR biogenesis. These inhibitors have the potential to (i) dissect miR mechanisms of action, (ii) discover new drug targets, and (iii) function as new therapeutic agents. Here, we designed Förster resonance energy transfer (FRET)-labeled oligoribonucleotides of the precursor of the oncogenic miR-21 (pre-miR-21) and used them together with a set of aminoglycosides to develop an interbase-FRET assay to detect ligand binding to pre-miRs. Our interbase-FRET assay accurately reports structural changes of the RNA oligonucleotide induced by ligand binding. We demonstrate its application in a rapid, qualitative drug candidate screen by assessing the relative binding affinity between 12 aminoglycoside antibiotics and pre-miR-21. Surface plasmon resonance (SPR) and isothermal titration calorimetry (ITC) were used to validate our new FRET method, and the accuracy of our FRET assay was shown to be similar to the established techniques. With its advantages over SPR and ITC owing to its high sensitivity, small sample size, straightforward technique and the possibility for high-throughput expansion, we envision that our solution-based method can be applied in pre-miRNA-target binding studies.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Interbase-FRET binding assay for pre-microRNAs
- Date Crossref
- 30/04/2021
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
AstraZeneca (Sweden) pays non établi dans la noticeEntreprise
-
University of Gothenburg Department of Chemistry and Molecular Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Chalmers University of Technology Department of Chemistry and Chemical Engineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Medicinal Chemistry pays non établi dans la noticeInstitution
-
Structure & Biophysics pays non établi dans la noticeInstitution
-
Oligonucleotide Discovery pays non établi dans la noticeInstitution
AstraZeneca (Sweden), Department of Chemistry and Molecular Biology — University of Gothenburg et Department of Chemistry and Chemical Engineering — Chalmers University of Technology, avec 3 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.