Interactome analysis of C. elegans synapses by TurboID-based proximity labeling
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Le résumé fourni par la source
Abstract Proximity labelling provides a powerful in vivo tool to characterize the proteome of sub-cellular structures and the interactome of specific proteins. Using the highly active biotin ligase TurboID, we optimize a proximity labelling protocol for C. elegans . We use this protocol to characterise the proteomes of the worm’s gut, muscle, skin, and nervous system. We express TurboID exclusively in the pair of AFD neurons and show we can identify known and previously unknown proteins expressed selectively in AFD. We knock TurboID into the endogenous elks-1 gene, which encodes a presynaptic active zone protein. We identify many known ELKS-1 interacting proteins as well as previously uncharacterised synaptic proteins. Versatile vectors, and the inherent advantage of C. elegans for biochemistry, make proximity labelling a valuable addition to the nematode’s armory. Teaser We optimize a TurboID proximity labeling protocol for C. elegans and use it to characterize tissue and synaptic proteomes
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.
- Titre Crossref
- Interactome analysis of <i>C. elegans</i> synapses by TurboID-based proximity labeling
- Date Crossref
- 01/04/2021
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Institute of Science and Technology Austria pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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MRC Laboratory of Molecular Biology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Medical Research Council Cell Biology Division pays non établi dans la noticeOrganisme public
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University of Cambridge Cambridge Institute Li Ka Shing Centre pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Cancer Research UK pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Institute of Science and Technology (IST) Austria pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Institute of Science and Technology Austria, MRC Laboratory of Molecular Biology et Cell Biology Division — Medical Research Council, avec 3 autres affiliations.
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