Genome-wide association of phenotypes based on clustering patterns of hand osteoarthritis identify WNT9A as novel osteoarthritis gene
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Le résumé fourni par la source
Background Despite recent advances in the understanding of the genetic architecture of osteoarthritis (OA), only two genetic loci have been identified for OA of the hand, in part explained by the complexity of the different hand joints and heterogeneity of OA pathology. Methods We used data from the Rotterdam Study (RSI, RSII and RSIII) to create three hand OA phenotypes based on clustering patterns of radiographic OA severity to increase power in our modest discovery genome-wide association studies in the RS (n=8700), and sought replication in an independent cohort, the Framingham Heart Study (n=1203). We used multiple approaches that leverage different levels of information and functional data to further investigate the underlying biological mechanisms and candidate genes for replicated loci. We also attempted to replicate known OA loci at other joint sites, including the hips and knees. Results We found two novel genome-wide significant loci for OA in the thumb joints. We identified WNT9A as a possible novel causal gene involved in OA pathogenesis. Furthermore, several previously identified genetic loci for OA seem to confer risk for OA across multiple joints: TGFa, RUNX2, COL27A1, ASTN2, IL11 and GDF5 loci. Conclusions We identified a robust novel genetic locus for hand OA on chromosome 1, of which WNT9A is the most likely causal gene. In addition, multiple genetic loci were identified to be associated with OA across multiple joints. Our study confirms the potential for novel insight into the genetic architecture of OA by using biologically meaningful stratified phenotypes.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Genome-wide association of phenotypes based on clustering patterns of hand osteoarthritis identify WNT9A as novel osteoarthritis gene
- Date Crossref
- 01/03/2021
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Erasmus MC pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Boston University Department of Rheumatology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Beth Israel Deaconess Medical Center Hebrew SeniorLife pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Hebrew SeniorLife pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Newcastle University Biosciences Institute pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Leiden University Medical Center Department of Internal Medicine pays non établi dans la noticeOrganisme public
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deCODE Genetics (Iceland) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Helmholtz Munich pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of Sheffield Department of Oncology and Metabolism pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Manchester Arthritis Research UK Epidemiology Unit pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Arthritis UK pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Harvard University Human Evolutionary Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Erasmus MC, Department of Rheumatology — Boston University et Hebrew SeniorLife — Beth Israel Deaconess Medical Center, avec 9 autres affiliations.
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