CpG Islands Shape the Epigenome Landscape
Rattachement africain : fr, gb, bg, sa. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Epigenetic modifications and nucleosome positioning play an important role in modulating gene expression. However, how the patterns of epigenetic modifications and nucleosome positioning are established around promoters is not well understood. Here, we have addressed these questions in a series of genome-wide experiments coupled to a novel bioinformatic analysis approach. Our data reveal a clear correlation between CpG density, promoter activity and accumulation of active or repressive histone marks. CGI boundaries define the chromatin promoter regions that will be epigenetically modified. CpG-rich promoters are targeted by histone modifications and histone variants, while CpG-poor promoters are regulated by DNA methylation. CGIs boundaries, but not transcriptional activity, are essential determinants of H2A.Z positioning in vicinity of the promoters, suggesting that the presence of H2A.Z is not related to transcriptional control. Accordingly, H2A.Z depletion has no impact on gene expression of arrested mouse embryonic fibroblasts. Therefore, the underlying DNA sequence, the promoter CpG density and, to a lesser extent, transcriptional activity, are key factors implicated in promoter chromatin architecture.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- CpG Islands Shape the Epigenome Landscape
- Date Crossref
- 01/03/2021
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Inserm pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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King's College London pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Bulgarian Academy of Sciences pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Institute of Molecular Biology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institut pour l'avancée des biosciences pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Université Grenoble Alpes Institute for Advanced Biosciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Umm al-Qura University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institut de Génétique et Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC) Libye (pays nommé en fin d’affiliation)Structure de recherche
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Biotechnology Research Center (BTRC) Libye (pays nommé en fin d’affiliation)Structure de recherche
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School of Cancer & Pharmaceutical Sciences Comprehensive Cancer Centre pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Centre National de la Recherche Scientifique, Inserm et Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire, avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Libye.
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