Aberrant X chromosomal rearrangement through multi‐step template switching during sister chromatid formation in a patient with severe hemophilia A
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BACKGROUND: Hemophilia A (HA) is an X-linked recessive bleeding disorder caused by pathogenic variants of the coagulation factor VIII gene (F8). Half of the patients with severe HA have a recurrent inversion in the X chromosome, that is, F8 intron 22 or intron 1 inversion. Here, we characterized an abnormal F8 due to atypical complex X chromosome rearrangements in a Japanese patient with severe HA. METHODS: Recurrent F8 inversions were tested with inverse shifting-PCR. The genomic structure was investigated using PCR-based direct sequencing or quantitative PCR. RESULTS: The proband's X chromosome had a 119.5 kb insertion, a reverse duplex of an extragenic sequence on the F8 telomere region into the F8 intron 1 with two breakpoints. The telomeric breakpoint was a joining from the F8 intron 1 to the inverted FUNDC2 via a two-base microhomology, and the centromeric breakpoint was a recombination between F8 intron 1 homologous sequences. The rearrangement mechanism was suggested as a multi-step rearrangement with template switching such as fork stalling and template switching (FoSTeS)/microhomology-mediated break-induced replication (MMBIR) and/or homologous sequence-associated recombination during a sister chromatid formation. CONCLUSION: We identified the aberrant X chromosome with a split F8 due to a multi-step rearrangement in a patient with severe HA.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Aberrant X chromosomal rearrangement through multi‐step template switching during sister chromatid formation in a patient with severe hemophilia A
- Date Crossref
- 05/07/2020
- Éditeur
- Wiley
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Nagoya University Department of Pathophysiological Laboratory Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Nagoya University Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Shubun University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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National Center for Geriatrics and Gerontology pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Department of Transfusion Medicine pays non établi dans la noticeInstitution
Department of Pathophysiological Laboratory Sciences — Nagoya University, Nagoya University Hospital et Shubun University, avec 2 autres affiliations.
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