Accès ouvert déclaré 2020 article

First international external quality assessment scheme of nucleic acid amplification tests for the detection of Schistosoma and soil-transmitted helminths, including Strongyloides: A pilot study

Piet Cools, Lisette van Lieshout, Rob Koelewijn, David G. Addiss, Sitara S. R. Ajjampur, Mio Ayana, Richard Stewart Bradbury, Jason L. Cantera, Daniel Dansa Dana, Kerstin Fischer, Rubina Imtiaz, Joyce Kabagenyi, James B. Lok, James S. McCarthy, Rojelio Mejía, Zeleke A. Mekonnen, Sammy M. Njenga, Nurulhasanah Othman, Hongguang Shao, Rebecca Justine Traub, Marjan Van Esbroeck, Jozef Vercruysse, Johnny Vlaminck, Steven A. Williams, Jaco J. Verweij, Jaap J. van Hellemond, Bruno Levecke

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22Institutions déclarées

9Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : be, nl, us, in, Éthiopie, Ouganda, au, Kenya, my. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

BACKGROUND: Nucleic acid amplification tests (NAATs) are increasingly being used as diagnostic tools for soil-transmitted helminths (STHs; Ascaris lumbricoides, Trichuris trichiura, Necator americanus, Ancylostoma duodenale and A. ceylanicum), Strongyloides stercoralis and Schistosoma in human stool. Currently, there is a large diversity of NAATs being applied, but an external quality assessment scheme (EQAS) for these diagnostics is lacking. An EQAS involves a blinded process where test results reported by a laboratory are compared to those reported by reference or expert laboratories, allowing for an objective assessment of the diagnostic performance of a laboratory. In the current study, we piloted an international EQAS for these helminths (i) to investigate the feasibility of designing and delivering an EQAS; (ii) to assess the diagnostic performance of laboratories; and (iii) to gain insights into the different NAAT protocols used. METHODS AND PRINCIPAL FINDINGS: A panel of twelve stool samples and eight DNA samples was validated by six expert laboratories for the presence of six helminths (Ascaris, Trichuris, N. americanus, Ancylostoma, Strongyloides and Schistosoma). Subsequently this panel was sent to 15 globally dispersed laboratories. We found a high degree of diversity among the different DNA extraction and NAAT protocols. Although most laboratories performed well, we could clearly identify the laboratories that were poorly performing. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: We showed the technical feasibility of an international EQAS for the NAAT of STHs, Strongyloides and Schistosoma. In addition, we documented that there are clear benefits for participating laboratories, as they can confirm and/or improve the diagnostic performance of their NAATs. Further research should aim to identify factors that explain poor performance of NAATs.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref: First international external quality assessment scheme of nucleic acid amplification tests for the detection of Schistosoma and soil-transmitted helminths, including Strongyloides: A pilot study
Date Crossref: 16/06/2020
Éditeur: Public Library of Science (PLoS)
Type: journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

Ghent University Laboratory of Parasitology pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Leiden University Medical Center pays non établi dans la notice
Organisme public
Medicines Evaluation Board pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Erasmus MC pays non établi dans la notice
Établissement de santé
The Task Force for Global Health pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
Christian Medical College pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Jimma University Jimma University, Éthiopie (code pays fourni par la source)
Université ou école supérieure
Centers for Disease Control and Prevention pays non établi dans la notice
Organisme public
Program for Appropriate Technology in Health pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
Washington University in St. Louis pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
MRC/UVRI & LSHTM Uganda Research Unit Ouganda (code pays fourni par la source)
Structure de recherche
Uganda Virus Research Institute Entebbe, Ouganda (code pays fourni par la source)
Structure de recherche

Laboratory of Parasitology — Ghent University, Leiden University Medical Center et Medicines Evaluation Board, avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Éthiopie, Ouganda, Kenya.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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