Accès ouvert déclaré 2020 article

Genome-wide association study of Buruli ulcer in rural Benin highlights role of two LncRNAs and the autophagy pathway

Jérémy Manry, Quentin B. Vincent, Christian Roch Johnson, Maya Chrabieh, Lazaro Lorenzo, Ioannis Théodorou, Marie-Françoise Ardant, Estelle Marion, Annick Chauty, Laurent Marsollier, Laurent Abel, Alexandre Alcaïs

21Citations signalées, ce qui n’est pas une note de qualité

14Institutions déclarées

4Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : fr, Bénin, Sénégal, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Abstract Buruli ulcer, caused by Mycobacterium ulcerans and characterized by devastating necrotizing skin lesions, is the third mycobacterial disease worldwide. The role of host genetics in susceptibility to Buruli ulcer has long been suggested. We conduct the first genome-wide association study of Buruli ulcer on a sample of 1524 well characterized patients and controls from rural Benin. Two-stage analyses identify two variants located within LncRNA genes: rs9814705 in ENSG00000240095.1 ( P = 2.85 × 10 −7 ; odds ratio = 1.80 [1.43–2.27]), and rs76647377 in LINC01622 ( P = 9.85 × 10 −8 ; hazard ratio = 0.41 [0.28–0.60]). Furthermore, we replicate the protective effect of allele G of a missense variant located in ATG16L1 , previously shown to decrease bacterial autophagy (rs2241880, P = 0.003; odds ratio = 0.31 [0.14–0.68]). Our results suggest LncRNAs and the autophagy pathway as critical factors in the development of Buruli ulcer.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref: Genome-wide association study of Buruli ulcer in rural Benin highlights role of two LncRNAs and the autophagy pathway
Date Crossref: 20/04/2020
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
Type: journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

Inserm pays non établi dans la notice
Organisme public
Institut des Maladies Génétiques Imagine pays non établi dans la notice
Structure de recherche
Université Paris Cité pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Actions pour l’Environnement et le Développement Durable Bénin (code pays fourni par la source)
Organisation à but non lucratif
Université d'Abomey-Calavi Université d'Abomey-Calavi, Bénin (code pays fourni par la source)
Université ou école supérieure
Ministère de l’Environnement et du Développement Durable Sénégal (code pays fourni par la source)
Organisme public
Fondation Raoul Follereau pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
Sorbonne Université pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Assistance Publique – Hôpitaux de Paris pays non établi dans la notice
Établissement de santé
Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses pays non établi dans la notice
Structure de recherche
Hôpital Saint-Louis pays non établi dans la notice
Établissement de santé
Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la notice
Organisme public

Inserm, Institut des Maladies Génétiques Imagine et Université Paris Cité, avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Bénin, Sénégal.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

Mycobacterium research and diagnosisCancer-related molecular mechanisms researchTuberculosis Research and Epidemiology

Lire en accès ouvert Consulter la publication primaire Ouvrir le DOI