Connecting Cancer Pathways to Tumor Engines: A Stratification Tool for Colorectal Cancer Combining Human In Vitro Tissue Models with Boolean In Silico Models
Rattachement africain : de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
To improve and focus preclinical testing, we combine tumor models based on a decellularized tissue matrix with bioinformatics to stratify tumors according to stage-specific mutations that are linked to central cancer pathways. We generated tissue models with BRAF-mutant colorectal cancer (CRC) cells (HROC24 and HROC87) and compared treatment responses to two-dimensional (2D) cultures and xenografts. As the BRAF inhibitor vemurafenib is—in contrast to melanoma—not effective in CRC, we combined it with the EGFR inhibitor gefitinib. In general, our 3D models showed higher chemoresistance and in contrast to 2D a more active HGFR after gefitinib and combination-therapy. In xenograft models murine HGF could not activate the human HGFR, stressing the importance of the human microenvironment. In order to stratify patient groups for targeted treatment options in CRC, an in silico topology with different stages including mutations and changes in common signaling pathways was developed. We applied the established topology for in silico simulations to predict new therapeutic options for BRAF-mutated CRC patients in advanced stages. Our in silico tool connects genome information with a deeper understanding of tumor engines in clinically relevant signaling networks which goes beyond the consideration of single drivers to improve CRC patient stratification.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Connecting Cancer Pathways to Tumor Engines: A Stratification Tool for Colorectal Cancer Combining Human In Vitro Tissue Models with Boolean In Silico Models
- Date Crossref
- 20/12/2019
- Éditeur
- MDPI AG
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Universitätsklinikum Würzburg pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Fraunhofer Institute for Silicate Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Würzburg Department of Bioinformatics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Rostock pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University Hospital Würzburg Chair of Tissue Engineering and Regenerative Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Friedrich-Alexander University of Erlangen-Nürnberg Chair of Medical Informatics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University Medical Center Rostock Department of Surgery pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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EMBL Heidelberg pays non établi dans la noticeInstitution
Universitätsklinikum Würzburg, Fraunhofer Institute for Silicate Research et Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg, avec 6 autres affiliations.
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