Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcriptional Regulators and Lineage Relationships
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Le résumé fourni par la source
Technological improvements enable single-cell epigenetic analyses of organ development. We reasoned that high-resolution single-cell chromatin accessibility mapping would provide needed insight into the epigenetic reprogramming and transcriptional regulators involved in normal mammary gland development. Here, we provide a single-cell resource of chromatin accessibility for murine mammary development from the peak of fetal mammary stem cell (fMaSC) functional activity in late embryogenesis to the differentiation of adult basal and luminal cells. We find that the chromatin landscape within individual cells predicts both gene accessibility and transcription factor activity. The ability of single-cell chromatin profiling to separate E18 fetal mammary cells into clusters exhibiting basal-like and luminal-like chromatin features is noteworthy. Such distinctions were not evident in analyses of droplet-based single-cell transcriptomic data. We present a web application as a scientific resource for facilitating future analyses of the gene regulatory networks involved in mammary development.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcriptional Regulators and Lineage Relationships
- Date Crossref
- 01/10/2019
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Salk Institute for Biological Studies pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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University of California San Diego Department of Cellular and Molecular Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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La Jolla Institute For Molecular Medicine pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Ludwig Cancer Research pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Gene Expression Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Ludwig Institute for Cancer Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Salk Institute for Biological Studies, Department of Cellular and Molecular Medicine — University of California San Diego et La Jolla Institute For Molecular Medicine, avec 3 autres affiliations.
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