Single-cell chromatin accessibility analysis of mammary gland development reveals cell state transcriptional regulators and cellular lineage relationships
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Summary It has only recently become possible to obtain single-cell level resolution of the epigenetic changes that occur during organ development. We reasoned that precision single-cell chromatin accessibility mapping of mammary gland development could provide needed insight into the epigenetic reprogramming and transcriptional regulators involved in normal mammary gland development. Here, we provide the first single-cell resource of chromatin accessibility for murine mammary development from the peak of fetal mammary stem cell (fMaSC) functional activity in late embryogenesis to the differentiation of adult basal and luminal cells. We find that the chromatin landscape within individual cells predicts both gene accessibility and transcription factor activity, and we present a web application as a scientific resource for facilitating future analyses. Strikingly, these single-cell chromatin profiling data reveal that fMaSCs can be separated into basal-like and luminal-like lineages, providing evidence of early lineage segregation prior to birth. Such distinctions were not evident in analyses of single-cell transcriptomic data.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Single-cell chromatin accessibility analysis of mammary gland development reveals cell state transcriptional regulators and cellular lineage relationships
- Date Crossref
- 02/05/2019
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Salk Institute for Biological Studies pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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University of California San Diego Department of Cellular and Molecular Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Ludwig Cancer Research pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Gene Expression Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Ludwig Institute for Cancer Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Salk Institute for Biological Studies, Department of Cellular and Molecular Medicine — University of California San Diego et Ludwig Cancer Research, avec 2 autres affiliations.
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