Postmortem Cortex Samples Identify Distinct Molecular Subtypes of ALS: Retrotransposon Activation, Oxidative Stress, and Activated Glia
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Summary Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disease characterized by the progressive loss of motor neurons. While several inherited pathogenic mutations have been identified as causative, the vast majority of cases are sporadic with no family history of disease. Thus, for the majority of ALS cases, a specific causal abnormality is not known and the disease may be a product of multiple inter-related pathways contributing to varying degrees in different ALS patients. Using unsupervised machine learning algorithms, we stratified the transcriptomes of 148 ALS decedent cortex tissue samples into three distinct and robust molecular subtypes. The largest cluster, identified in 61% of patient samples, displayed hallmarks of oxidative and proteotoxic stress. Another 20% of the ALS patient samples exhibited high levels of retrotransposon expression and other signatures of TDP-43 dysfunction. Finally, a third group showed predominant signatures of glial activation (19%). Together these results demonstrate that at least three distinct molecular signatures contribute to ALS disease. While multiple dysregulated components and pathways comprising these clusters have previously been implicated in ALS pathogenesis, unbiased analysis of this large survey demonstrated that sporadic ALS patient tissues can be segregated into distinct molecular subsets.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Postmortem Cortex Samples Identify Distinct Molecular Subtypes of ALS: Retrotransposon Activation, Oxidative Stress, and Activated Glia
- Date Crossref
- 11/03/2019
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Cold Spring Harbor Laboratory pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
New York Genome Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Johns Hopkins University Department of Neurology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Johns Hopkins Medicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
University of California San Diego Department of Neurosciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Stony Brook University Department of Anesthesiology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Center for Genomics of Neurodegenerative Diseases pays non établi dans la noticeInstitution
-
The NYGC ALS Consortium pays non établi dans la noticeInstitution
Cold Spring Harbor Laboratory, New York Genome Center et Department of Neurology — Johns Hopkins University, avec 5 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.