Accès ouvert déclaré 2018 article

Lamin B1 mapping reveals the existence of dynamic and functional euchromatin lamin B1 domains

Laura Pascual‐Reguant, Enrique Blanco, Silvia Galan, François Le Dily, Yasmina Cuartero, Gemma Serra‐Bardenys, Valerio Di Carlo, Ane Iturbide, Joan Pau Cebrià‐Costa, Lara Nonell, Antonio Garcı́a de Herreros, Luciano Di Croce, Marc A. Martı́-Renom, Sandra Peiró

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Le résumé fourni par la source

Lamins (A/C and B) are major constituents of the nuclear lamina (NL). Structurally conserved lamina-associated domains (LADs) are formed by genomic regions that contact the NL. Lamins are also found in the nucleoplasm, with a yet unknown function. Here we map the genome-wide localization of lamin B1 in an euchromatin-enriched fraction of the mouse genome and follow its dynamics during the epithelial-to-mesenchymal transition (EMT). Lamin B1 associates with actively expressed and open euchromatin regions, forming dynamic euchromatin lamin B1-associated domains (eLADs) of about 0.3 Mb. Hi-C data link eLADs to the 3D organization of the mouse genome during EMT and correlate lamin B1 enrichment at topologically associating domain (TAD) borders with increased border strength. Having reduced levels of lamin B1 alters the EMT transcriptional signature and compromises the acquisition of mesenchymal traits. Thus, during EMT, the process of genome reorganization in mouse involves dynamic changes in eLADs.

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Titre Crossref: Lamin B1 mapping reveals the existence of dynamic and functional euchromatin lamin B1 domains
Date Crossref: 24/08/2018
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
Type: journal-article

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Vall d'Hebron Institute of Oncology pays non établi dans la notice
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Hospital del Mar Research Institute pays non établi dans la notice
Établissement de santé
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Vall d'Hebron Institut de Recerca pays non établi dans la notice
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The Barcelona Institute of Science and Technology Centre for Genomic Regulation (CRG) pays non établi dans la notice
Structure de recherche
Departament de Ciències Experimentals i de la Salut pays non établi dans la notice
Institution
Servei d'Anàlisi de Microarrays Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques Programa de Recerca en Càncer pays non établi dans la notice
Structure de recherche
Pg. Lluis Companys 23 ICREA pays non établi dans la notice
Entreprise

Vall d'Hebron Institute of Oncology, Centre for Genomic Regulation et Universitat Pompeu Fabra, avec 9 autres affiliations.

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