2018 article

isiKnock: in silico knockouts in signaling pathways

Jennifer Hannig, Heiko Giese, Börje Schweizer, Leonie K. Amstein, Jörg Ackermann, Ina Koch

10Citations signalées, ce qui n’est pas une note de qualité

2Institutions déclarées

1Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

SUMMARY: isiKnock is a new software that automatically conducts in silico knockouts for mathematical models of signaling pathways. The software allows for the prediction of the behavior of biological systems after single or multiple knockout. The implemented algorithm applies transition invariants and the novel concept of Manatee invariants. A knockout matrix visualizes the results. The tool enables the analysis of dependencies, for example, in signal flows from the receptor activation to the cell response at steady state. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: isiKnock is an open-source tool, freely available at http://www.bioinformatik.uni-frankfurt.de/tools/isiKnock/. It requires at least Java 8 and runs under Microsoft Windows, Linux, and Mac OS.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.

Titre Crossref: isiKnock: <i>in silico</i> knockouts in signaling pathways
Date Crossref: 09/08/2018
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
Type: journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

Goethe University Frankfurt pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Technische Hochschule Mittelhessen pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Department of KITE - Kompetenzzentrum für Informationstechnologie pays non établi dans la notice
Institution
Johann Wolfgang Goethe-University Department of Molecular Bioinformatics pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure

Goethe University Frankfurt, Technische Hochschule Mittelhessen et Department of KITE - Kompetenzzentrum für Informationstechnologie, avec 1 autre affiliation.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

Gene Regulatory Network AnalysisBioinformatics and Genomic NetworksGenomics and Chromatin Dynamics

Consulter la publication primaire Ouvrir le DOI