Binding mode of AIF(370–394) peptide to CypA: insights from NMR, label-free and molecular docking studies
Rattachement africain : it. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The complex formation between the proteins apoptosis-inducing factor (AIF) and cyclophilin A (CypA) following oxidative stress in neuronal cells has been suggested as a main target for reverting ischemia-stroke damage. Recently, a peptide encompassing AIF residues 370–394 has been developed to target the AIF-binding site on CypA, to prevent the association between the two proteins and suppress glutamate-induced cell death in neuronal cells. Using a combined approach based on NMR spectroscopy, synthesis and in vitro testing of all Ala-scan mutants of the peptide and molecular docking/molecular dynamics, we have generated a detailed model of the AIF (370–394)/CypA complex. The model suggests us that the central region of the peptide spanning residues V374–K384 mostly interacts with the protein and that for efficient complex inhibition and preservation of CypA activity, it is bent around amino acids F46–G75 of the protein. The model is consistent with experimental data also from previous works and supports the concept that the peptide does not interfere with other CypA activities unrelated to AIF activation; therefore, it may serve as an ideal template for generating future non-peptidic antagonists.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Binding mode of AIF(370–394) peptide to CypA: insights from NMR, label-free and molecular docking studies
- Date Crossref
- 31/07/2018
- Éditeur
- Portland Press Ltd.
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Institute of Biostructure and Bioimaging pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
University of Padua pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
University of Campania "Luigi Vanvitelli" pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Istituto di Biostrutture e Bioimmagini (IBB)-CNR and CIRPeB pays non établi dans la noticeInstitution
-
Via Mezzocannone 16 pays non établi dans la noticeInstitution
-
Molecular Modeling Section pays non établi dans la noticeInstitution
-
Dipartimento di Scienze e Tecnologie Ambientali Biologiche e Farmaceutiche pays non établi dans la noticeInstitution
Institute of Biostructure and Bioimaging, University of Padua et University of Campania "Luigi Vanvitelli", avec 4 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.