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Accès ouvert déclaré 2017 article

Analysis of the natively unstructured RNA/protein-recognition core in the Escherichia coli RNA degradosome and its interactions with regulatory RNA/Hfq complexes

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2Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : gb, be. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

The RNA degradosome is a multi-enzyme assembly that plays a central role in the RNA metabolism of Escherichia coli and numerous other bacterial species including pathogens. At the core of the assembly is the endoribonuclease RNase E, one of the largest E. coli proteins and also one that bears the greatest region predicted to be natively unstructured. This extensive unstructured region, situated in the C-terminal half of RNase E, is punctuated with conserved short linear motifs that recruit partner proteins, direct RNA interactions, and enable association with the cytoplasmic membrane. We have structurally characterized a subassembly of the degradosome-comprising a 248-residue segment of the natively unstructured part of RNase E, the DEAD-box helicase RhlB and the glycolytic enzyme enolase, and provide evidence that it serves as a flexible recognition centre that can co-recruit small regulatory RNA and the RNA chaperone Hfq. Our results support a model in which the degradosome captures substrates and regulatory RNAs through the recognition centre, facilitates pairing to cognate transcripts and presents the target to the ribonuclease active sites of the greater assembly for cooperative degradation or processing.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Analysis of the natively unstructured RNA/protein-recognition core in the Escherichia coli RNA degradosome and its interactions with regulatory RNA/Hfq complexes
Date Crossref
09/11/2017
Éditeur
Oxford University Press (OUP)
Type
journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • University of Cambridge Department of Biochemistry pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University of Leeds Astbury Centre for Structural Molecular Biology pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University of Antwerp Department of Chemistry pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Vrije Universiteit Brussel Structural Biology Brussels pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • VIB-VUB Center for Structural Biology pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • School of Molecular and Cellular Biology pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure

Department of Biochemistry — University of Cambridge, Astbury Centre for Structural Molecular Biology — University of Leeds et Department of Chemistry — University of Antwerp, avec 3 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

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