Identification of Antibody Targets for Tuberculosis Serology using High-Density Nucleic Acid Programmable Protein Arrays
Rattachement africain : us, cn, Afrique du Sud, mm. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Better and more diverse biomarkers for the development of simple point-of-care tests for active tuberculosis (TB), a clinically heterogeneous disease, are urgently needed. We generated a proteomic Mycobacterium tuberculosis ( Mtb ) High-Density Nucleic Acid Programmable Protein Array (HD-NAPPA) that used a novel multiplexed strategy for expedited high-throughput screening for antibody responses to the Mtb proteome. We screened sera from HIV uninfected and coinfected TB patients and controls ( n = 120) from the US and South Africa (SA) using the multiplex HD-NAPPA for discovery, followed by deconvolution and validation through single protein HD-NAPPA with biologically independent samples ( n = 124). We verified the top proteins with enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA) using the original screening and validation samples ( n = 244) and heretofore untested samples ( n = 41). We identified 8 proteins with TB biomarker value; four (Rv0054, Rv0831c, Rv2031c and Rv0222) of these were previously identified in serology studies, and four (Rv0948c, Rv2853, Rv3405c, Rv3544c) were not known to elicit antibody responses. Using ELISA data, we created classifiers that could discriminate patients' TB status according to geography (US or SA) and HIV (HIV- or HIV+) status. With ROC curve analysis under cross validation, the classifiers performed with an AUC for US/HIV- at 0.807; US/HIV+ at 0.782; SA/HIV- at 0.868; and SA/HIV+ at 0.723. With this study we demonstrate a new platform for biomarker/antibody screening and delineate its utility to identify previously unknown immunoreactive proteins.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Identification of Antibody Targets for Tuberculosis Serology using High-Density Nucleic Acid Programmable Protein Arrays
- Date Crossref
- 01/04/2017
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Arizona State University The Biodesign Institute pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Beijing Proteome Research Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Engineering Arts (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Edendale Hospital Afrique du Sud (code pays fourni par la source)Établissement de santé
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University of KwaZulu-Natal Edendale Hospital University of KwaZulu-Natal, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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University Of Medicine 1 Yangon pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Albert Einstein College of Medicine ‡‡Microbiology and Immunology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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§State Key Laboratory of Proteomics pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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¶Engineering Arts LLC pays non établi dans la noticeInstitution
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**Departments of Medicine and pays non établi dans la noticeInstitution
The Biodesign Institute — Arizona State University, Beijing Proteome Research Center et Engineering Arts (United States), avec 7 autres affiliations. Pays d’affiliation : Afrique du Sud.
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