The DOE Systems Biology Knowledgebase (KBase)
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract The U.S. Department of Energy Systems Biology Knowledgebase (KBase) is an open-source software and data platform designed to meet the grand challenge of systems biology — predicting and designing biological function from the biomolecular (small scale) to the ecological (large scale). KBase is available for anyone to use, and enables researchers to collaboratively generate, test, compare, and share hypotheses about biological functions; perform large-scale analyses on scalable computing infrastructure; and combine experimental evidence and conclusions that lead to accurate models of plant and microbial physiology and community dynamics. The KBase platform has (1) extensible analytical capabilities that currently include genome assembly, annotation, ontology assignment, comparative genomics, transcriptomics, and metabolic modeling; (2) a web-browser-based user interface that supports building, sharing, and publishing reproducible and well-annotated analyses with integrated data; (3) access to extensive computational resources; and (4) a software development kit allowing the community to add functionality to the system.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- The DOE Systems Biology Knowledgebase (KBase)
- Date Crossref
- 22/12/2016
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Lawrence Berkeley National Laboratory Environmental Genomics and Systems Biology Division pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of California Department of Bioengineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Argonne National Laboratory and Life Sciences Directorate pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of Chicago Computer Science Department and Computation Institute pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Oak Ridge National Laboratory Biosciences Division pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Brookhaven National Laboratory Biology Department pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Cold Spring Harbor Laboratory pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Hope College Department of Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Yale University Program in Computational Biology and Bioinformatics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Joint BioEnergy Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of Illinois Urbana-Champaign pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Urbana University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Environmental Genomics and Systems Biology Division — Lawrence Berkeley National Laboratory, Department of Bioengineering — University of California et and Life Sciences Directorate — Argonne National Laboratory, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.