Identification and characterization of RNA guanine-quadruplex binding proteins
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Le résumé fourni par la source
Guanine quadruplex (G-quadruplex) motifs in the 5' untranslated region (5'-UTR) of mRNAs were recently shown to influence the efficiency of translation. In the present study, we investigate the interaction between cellular proteins and the G-quadruplexes located in two mRNAs (MMP16 and ARPC2). Formation of the G-quadruplexes was confirmed by biophysical characterization and the inhibitory activity on translation was shown by luciferase reporter assays. In experiments with whole cell extracts from different eukaryotic cell lines, G-quadruplex-binding proteins were isolated by pull-down assays and subsequently identified by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. The binding partners of the RNA G-quadruplexes we discovered included several heterogeneous nuclear ribonucleoproteins, ribosomal proteins, and splicing factors, as well as other proteins that have previously not been described to interact with nucleic acids. While most of the proteins were specific for either of the investigated G-quadruplexes, some of them bound to both motifs. Selected candidate proteins were subsequently produced by recombinant expression and dissociation constants for the interaction between the proteins and RNA G-quadruplexes in the low nanomolar range were determined by surface plasmon resonance spectroscopy. The present study may thus help to increase our understanding of the mechanisms by which G-quadruplexes regulate translation.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Identification and characterization of RNA guanine-quadruplex binding proteins
- Date Crossref
- 25/04/2014
- Éditeur
- Oxford University Press (OUP)
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Technische Universität Berlin pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Stuttgart Institute for Cell Biology and Immunology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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RiNA (Germany) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Goethe University Frankfurt pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Max Planck Institute of Colloids and Interfaces pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Max Planck Institute for Molecular Genetics pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Freie Universität Berlin pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institute of Biotechnology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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RiNA GmbH pays non établi dans la noticeEntreprise
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University of Frankfurt Institute for Molecular Biosciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institute of Chemistry and Biochemistry pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Technische Universität Berlin, Institute for Cell Biology and Immunology — University of Stuttgart et RiNA (Germany), avec 8 autres affiliations.
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