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Artem Podvalnyi

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Genomic variations and chromosomal abnormalitiesGenomics and Phylogenetic StudiesGenomics and Chromatin DynamicsChromosomal and Genetic VariationsGenomics and Rare Diseases

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Accès ouvert 2026 preprint OpenAlex

Systematic analysis of insertions signature in gnomAD revealed large set of novel processed pseudogenes

Artem Podvalnyi, Varvara V. Kucherenko, Natalia Doroschuk, Elizaveta V. Sarygina et autres

Abstract Pseudogenes are non-functional copies of protein-coding genes that arise through genomic duplication or retrotransposition. Processed pseudogenes (PPs) is the most abundant class of pseudogenes, which is generated via mRNA reverse transcription and subsequent cDNA integration. Presence of PPs complicates the analysis …

cz, ru (code pays fourni par la source)

0 citations bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)

Accès ouvert 2025 article OpenAlex

Quantitative Analysis of Pseudogene-Associated Errors During Germline Variant Calling

Artem Podvalnyi, Arina Kopernik, Mariia Sayganova, Mary V. Woroncow et autres

A pseudogene is a non-functional copy of a protein-coding gene. Processed pseudogenes, which are created by the reverse transcription of mRNA and subsequent integration of the resulting cDNA into the genome, being a major pseudogene class, represent a significant challenge in genome …

ru (code pays fourni par la source)

8 citations International Journal of Molecular Sciences

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