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Erin McCarthy

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Cancer Genomics and DiagnosticsEpigenetics and DNA MethylationSemantic Web and OntologiesPancreatic and Hepatic Oncology ResearchPrenatal Screening and Diagnostics

Les publications récentes

Accès ouvert 2025 article OpenAlex

Evaluating the Diagnostic Performance of Long-Read Metagenomic Sequencing Compared to Culture and Antimicrobial Susceptibility Testing for Detection of Bovine Respiratory Bacteria and Indicators of Antimicrobial Resistance

Jennifer N. Abi Younes, Lianne McLeod, Simon J. G. Otto, Zhijian Chai et autres

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5 citations Antibiotics

Accès ouvert 2025 article OpenAlex

Respiratory Bacteria and Antimicrobial Resistance Genes Detected by Long-Read Metagenomic Sequencing Following Feedlot Arrival, Subsequent Treatment Risk and Phenotypic Resistance in Feedlot Calves

Jennifer N. Abi Younes, Lianne McLeod, Stacey Lacoste, Zhijian Chai et autres

ca (code pays fourni par la source)

5 citations Antibiotics

2025 article OpenAlex

47. A prairie province wide survey of Canadian swine fecal microbiomes reveals a high degree of variation between barns

Maureen Rogers, Bonita McCuaig, Erin McCarthy, Stephanie Saundh et autres

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0 citations Animal - science proceedings

Accès ouvert 2024 article OpenAlex

Bacterial enrichment prior to third-generation metagenomic sequencing improves detection of BRD pathogens and genetic determinants of antimicrobial resistance in feedlot cattle

Emily K. Herman, Stacey Lacoste, Claire N. Freeman, Simon J. G. Otto et autres

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19 citations Frontiers in Microbiology

Accès ouvert 2023 article OpenAlex

98 Characterization of Factors Affecting the Fecal Microbiome in Young Canadian Pigs

Bonita McCuaig, Stephanie Saundh, Erin McCarthy, Tausha L. Prisnee et autres

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0 citations Journal of Animal Science

Accès ouvert 2023 article OpenAlex

Epigenomic Blood-Based Early Detection of Pancreatic Cancer Employing Cell-Free DNA

David Haan, Anna Bergamaschi, Verena Friedl, Gulfem D. Guler et autres

44 citations Clinical Gastroenterology and Hepatology

Accès ouvert 2022 article OpenAlex

The 5-Hydroxymethylcytosine Landscape of Prostate Cancer

Martin Sjöström, Shuang G. Zhao, Samuel Levy, Meng Zhang et autres

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70 citations Cancer Research

Accès ouvert 2021 article OpenAlex

Genome-wide Sequencing of Cell-free DNA Enables Detection of Copy-number Alterations in Patients with Cancer Where Tissue Biopsy is Not Feasible

Taylor J. Jensen, Aaron M. Goodman, Christopher K. Ellison, Kimberly A. Holden et autres

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9 citations Molecular Cancer Therapeutics

Accès ouvert 2021 preprint OpenAlex

5-hydroxymethyl Cytosine (5hmC) enrichment

Chris Ellison, Tierney Phillips, Erin McCarthy, Gulfem D. Guler et autres

gb (code pays fourni par la source)

0 citations Research Square

2021 conference-abstract OpenAlex

Genome-wide 5hmC profiles to enable cancer detection and tissue of origin classification in breast, colorectal, lung, ovarian, and pancreatic cancers.

David Haan, Anna Bergamaschi, Yuhong Ning, William J. Gibb et autres

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1 citation Journal of Clinical Oncology

Accès ouvert 2021 article OpenAlex

CaptureSeq: Hybridization-Based Enrichment of cpn60 Gene Fragments Reveals the Community Structures of Synthetic and Natural Microbial Ecosystems

Matthew G. Links, Tim Dumonceaux, Erin McCarthy, Sean M. Hemmingsen et autres

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25 citations Microorganisms

Accès ouvert 2020 article OpenAlex

Detection of early stage pancreatic cancer using 5-hydroxymethylcytosine signatures in circulating cell free DNA

Gulfem D. Guler, Yuhong Ning, Chin‐Jen Ku, Tierney Phillips et autres

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186 citations Nature Communications

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