Chorus: chatting with genomic oracles
Dmitry Penzar, Lorenzo Ruggeri, Jiecong Lin, Rosalba Giugno et autres
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Jiecong Lin
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Genomics and Chromatin DynamicsSingle-cell and spatial transcriptomicsRNA and protein synthesis mechanismsCRISPR and Genetic EngineeringGene expression and cancer classification
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Chorus: chatting with genomic oracles
Dmitry Penzar, Lorenzo Ruggeri, Jiecong Lin, Rosalba Giugno et autres
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Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
Large-scale genome- and phenome-wide analyses reveal the genetic architecture, pathophysiology and comorbidity of restless legs syndrome
Xiaoxi Jing, Zi Wang, Jacob Williams, Junpeng Zhao et autres
cn, us (code pays fourni par la source)
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medRxiv
EPInformer: scalable and integrative prediction of gene expression from promoter-enhancer sequences with multimodal epigenomic profiles
Jiecong Lin, Zhijian Li, Yajie Zhao, Ruibang Luo et autres
hk, us (code pays fourni par la source)
4 citations
Nature Communications
Genome-wide maps of transcription factor footprints identify noncoding variants rewiring gene regulatory networks
Jiecong Lin, Wenyang Dong, Jiaxiang Zhang, Chen Xie et autres
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Spatial GWAS Atlas: a knowledgebase for decoding the genetic architecture of complex traits in spatial resolution
Hongen Kang, Xiaoxi Jing, Jiecong Lin, Siyu Pan et autres
us (code pays fourni par la source)
2 citations
Nucleic Acids Research
Protein-truncating variants in UQCRC1 are associated with Parkinson’s disease: evidence from half-million people
Xiaoxi Jing, Zongzhi Liu, Wen Li, K. Ma et autres
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3 citations
npj Parkinson s Disease
Unveiling Multi‐Scale Architectural Features in Single‐Cell Hi‐C Data Using scCAFE
Fuzhou Wang, Jiecong Lin, Hamid Alinejad‐Rokny, Wenjing Ma et autres
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2 citations
Advanced Science
Ctrl-DNA: Controllable Cell-Type-Specific Regulatory DNA Design via Constrained RL
Xingyu Chen, Shihao Ma, Jiecong Lin, Bo Wang
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Unveiling multi-scale architectural features in single-cell Hi-C data using scCAFE
Fuzhou Wang, Jiecong Lin, Hamid Alinejad-Rokny, Wenjing Ma et autres
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
UniPTM: Multiple PTM site prediction on full-length protein sequence
Lingkuan Meng, Jiecong Lin, Ke Cheng, Kui Xu et autres
hk, us, cn (code pays fourni par la source)
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
EPInformer: A Scalable Deep Learning Framework for Gene Expression Prediction by Integrating Promoter-enhancer Sequences with Multimodal Epigenomic Data
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13 citations
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
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