mV2G: a multiomic atlas for tissue-specific variant-to-gene prioritization
Dean Y Zhang, Hufeng Zhou, Maya U. Sheth, Andreas R. Gschwind et autres
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Andreas R. Gschwind
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Single-cell and spatial transcriptomicsGenomics and Chromatin DynamicsGenomic variations and chromosomal abnormalitiesCRISPR and Genetic EngineeringGenomics and Rare Diseases
Les publications récentes
Mapping enhancer–gene regulatory interactions from single-cell data
Maya U. Sheth, Wei‐Lin Qiu, X. Rosa, Andreas R. Gschwind et autres
us, dk, de (code pays fourni par la source)
23 citations
Nature Genetics
Targeted single-cell RNA and perturbation sequencing with TAP-seq
Dewi Moonen, Daniel Schraivogel, Andreas R. Gschwind, Lars M. Steinmetz
de, us, gb (code pays fourni par la source)
0 citations
Nature Protocols
PerturbPlan: An analytical framework for designing Perturb-seq experiments
Ziang Niu, Yihui He, James Galante, Andreas R. Gschwind et autres
us, de (code pays fourni par la source)
1 citation
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Genome-scale mapping of variant, enhancer and gene function in primary human CD4+ T cells
Dewi Moonen, Annique Claringbould, Andreas R. Gschwind, Stefan Schrod et autres
gb, de, nl, us, ch (code pays fourni par la source)
1 citation
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Innate immune responses to Plasmodium falciparum disrupt the blood-brain barrier
Alina Batzilla, Pia Dernick, Jon Bezney, Andreas R. Gschwind et autres
es, us (code pays fourni par la source)
1 citation
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
A systematic survey of distal element-gene regulatory interactions with Direct-Capture Targeted Perturb-seq
Judhajeet Ray, Evelyn Jagoda, Maya U. Sheth, James Galante et autres
us, de (code pays fourni par la source)
5 citations
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Enhancer-targeting CRISPR screens at coronary artery disease loci suggest shared mechanisms of disease risk
Markus Ramste, Chad S. Weldy, Soumya Kundu, Quanyi Zhao et autres
us, fi (code pays fourni par la source)
5 citations
medRxiv
Mapping Enhancer–Gene Interactions with Direct-Capture Targeted Perturb-seq (DC-TAP-seq) v1
Judhajeet Ray, Evelyn Jagoda, Dulguun Amgalan, James Galante et autres
us (code pays fourni par la source)
1 citation
A consensus variant-to-function score to functionally prioritize variants for disease
Tabassum Fabiha, Ivy Evergreen, Soumya Kundu, Anusri Pampari et autres
us (code pays fourni par la source)
10 citations
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Deciphering the impact of genomic variation on function
J Engreitz, Heather A. Lawson, Harinder Singh, Lea M. Starita et autres
us, de, fr (code pays fourni par la source)
93 citations
Nature
Cohesin-mediated 3D contacts tune enhancer-promoter regulation
Philine Guckelberger, Benjamin R. Doughty, Glen Munson, Suhas S.P. Rao et autres
us, de, jp (code pays fourni par la source)
33 citations
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
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