An integrated, transcript-resolution atlas of prostate cancer progression unmasks associations with oncogenic pathways
Rattachement africain : au, ch, it. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Most genes produce multiple non-coding and coding RNA transcripts with potentially divergent biological functions, yet their contribution to cancer remains largely unexplored. Here, we built an integrated, transcript-resolution RNA sequencing atlas of prostate cancer spanning 1,140 clinical samples from 10 independent studies, covering the full range of disease progression from normal tissue to primary, hormone-sensitive, and castration-resistant disease. Cross-study integration removes technical batch effects while retaining the biological heterogeneity that distinguishes these disease states, a property we validate against long-read sequencing and leverage to place newly incorporated external cohorts within this disease-progression context. We describe transcript patterns of oncogenic and tumor-suppressive long non-coding RNAs along disease progression and identify 41 protein-coding genes with significant isoform switches in cancer-relevant pathways, including WNT2B, RNF43, RELA, BRCA1, ROCK2, and TRIM11. Finally, we provide the Prostate Cancer Atlas (www.prostatecanceratlas.org), an interactive web resource that lets researchers contextualize their own transcriptomic data against this atlas.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- An integrated, transcript-resolution atlas of prostate cancer progression unmasks associations with oncogenic pathways
- Date Crossref
- 22/09/2026
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Tabor College pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Università della Svizzera italiana pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Mario Negri Institute for Pharmacological Research pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Institute of Oncology Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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IOR pays non établi dans la noticeInstitution
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Institute for Research in Biomedicine Switzerland pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Tabor College, Università della Svizzera italiana et Mario Negri Institute for Pharmacological Research, avec 3 autres affiliations.
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