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broadinstitute/viral-pipelines: v3.0.24.0

Daniel Park, Chris Tomkins-Tinch, Simon Ye, Irwin Jungreis, Flavia, Ilya A. Shlyakhter, Hayden C. Metsky, Sushma Chaluvadi, Lydia Andreyevna Krasilnikova, Juan Pablo Ramos Barroso, Hanna, Mike Lin, Venkat Malladi, Aaron Lin, Vang Le, cmloreth, llangit-broad, Katrin Leinweber, pvanheus

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6Institutions déclarées

5Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : us, ru, jp, de, gb. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

What's Changed find_illumina_files: find fastqs in nested run folders, and stop failing silently by @dpark01 in https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/pull/680 bump viral-ngs 3.0.22, and cover no-lane-splitting FASTQ names in CI by @dpark01 in https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/pull/681 bump viral-ngs 3.0.24, and cover single-sample 3-barcode pools in CI by @dpark01 in https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/pull/682 The above fixes upstream and in here address edge cases introduced by 1) onboard DRAGEN fastq demux on NextSeq 2000 combined with 3-barcode pooled swiftseq, 2) three barcode scenarios where each pool contains only one library, 3) scenarios where a single sample has multiple library preps within the same lane and same 3bc pool. See upstream changes in viral-ngs for more details. Full Changelog: https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/compare/v3.0.21.0...v3.0.24.0

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

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Où se fait cette recherche

Broad Institute pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
Moscow Institute of Thermal Technology pays non établi dans la notice
Structure de recherche
Ltd. (Japan) Merck Biopharma Co. pays non établi dans la notice
Entreprise
Dynavax Technologies (Germany) pays non établi dans la notice
Entreprise
Novo Nordisk (United Kingdom) pays non établi dans la notice
Entreprise
Independent Sector pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
MIT pays non établi dans la notice
Institution
Merck pays non établi dans la notice
Institution
DynoTx pays non établi dans la notice
Institution

Broad Institute, Moscow Institute of Thermal Technology et Merck Biopharma Co. — Ltd. (Japan), avec 6 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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