Comparative Transcriptomic Profiling Identifies Region- and Phenotypic-Background-Associated Transcriptional Programs Linked to Coat-Color Variation in Junken Meat Sheep
Rattachement africain : cn. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Junken meat sheep display distinct coat-color phenotypes, including a white body with a black head and an entirely black coat at birth, but the transcriptional basis of variation across skin regions and phenotypic backgrounds remains unclear. We performed bulk RNA sequencing (RNA-seq) on nine skin samples from six 1-month-old lambs: black-haired head skin (BT), white-haired dorsal trunk skin (WT), and black-haired dorsal trunk skin from lambs born entirely black (B), with three biological replicates per group. The paired BT–WT comparison characterized within-individual regional differences, whereas B–WT represented a composite phenotypic-background comparison. Cross-comparison integration identified 2056 region-associated genes, 8027 phenotypic-background-associated genes, and 5615 shared genes. Region-associated genes were enriched in mitochondrial and lipid-metabolic processes, phenotypic-background-associated genes in cell communication and adhesion, and shared genes in epidermal keratinization, cytoskeletal organization, and extracellular matrix–integrin-related processes. Network analysis identified a pigmentation-effector subnetwork containing TYR, TYRP1, PMEL, OCA2, SLC45A2 and MYO5A. Signature scoring suggested that some contractile signals may reflect tissue-composition differences. Reverse transcription quantitative PCR broadly supported the RNA-seq expression trends. These findings provide a multilayered transcriptional framework for subsequent functional validation of coat-color variation in Junken meat sheep.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Comparative Transcriptomic Profiling Identifies Region- and Phenotypic-Background-Associated Transcriptional Programs Linked to Coat-Color Variation in Junken Meat Sheep
- Date Crossref
- 26/08/2026
- Éditeur
- MDPI AG
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation Science pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Chinese Academy of Agricultural Sciences pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Ministry of Agriculture and Rural Affairs pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Northeast Agricultural University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Key Laboratory of Animal Genetics and Breeding on the Tibetan Plateau pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Sheep Breeding Engineering Technology Research Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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State Key Laboratory of Sheep Genetic Improvement and Healthy Production pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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College of Animal Science and Technology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences, Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation Science et Chinese Academy of Agricultural Sciences, avec 6 autres affiliations.
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