Organellar Genome Analysis of the Red Alga Rhodymenia intricata (Rhodophyta, Florideophyceae) and Its Phylogenetic Analysis
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Le résumé fourni par la source
Red algae (Rhodophyta) are an ancient lineage of photosynthetic eukaryotes that play important roles in marine ecosystems. However, genomic information for many species within the order Rhodymeniales remains limited, particularly for mitochondrial genomes. In this study, we sequenced, assembled, and analyzed the complete mitochondrial genome (mitogenome) of Rhodymenia intricata to investigate its genome organization, gene content, and phylogenetic position within Rhodymeniales. The mitogenome of R. intricata is a circular DNA molecule of 26,213 bp containing 49 genes, including 25 protein-coding genes (PCGs), 21 tRNA genes, and 3 rRNA genes. The genome shows a strong A + T bias (70.9%) and positive AT and GC skews, typical of red algal mitogenomes. Comparative analysis with other Rhodymeniales mitogenomes revealed generally conserved gene content and organization, with several lineage-specific features such as the presence of the rpl20 gene, an additional open reading frame (orf148), and three rRNA genes (rnl, rns, and rns5). Codon usage analysis indicated a preference for leucine and isoleucine codons and dominant start and stop codons (ATG and TAA). Phylogenetic analysis based on a concatenated dataset of 23 mitochondrial PCGs strongly supported the monophyly of Rhodymeniales and confirmed the close relationship between R. intricata and R. pseudopalmata. Overall, this study presents the first complete mitogenome of R. intricata and expands mitogenomic resources for Rhodymeniales, providing new insights into mitogenome evolution and phylogenetic relationships in red algae.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Organellar Genome Analysis of the Red Alga Rhodymenia intricata (Rhodophyta, Florideophyceae) and Its Phylogenetic Analysis
- Date Crossref
- 24/08/2026
- Éditeur
- MDPI AG
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Parul University Department of Life Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Pukyong National University Department of Microbiology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Korea Environmental Industry and Technology Institute pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Mie University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Shri Vile Parle Kelavani Mandal pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Marine and Fisheries Life Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Marine Eco-Technology Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Faculty of Bioresources Graduate School pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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H. R. Patel Institute of Pharmaceutical Education and Research Department of Quality Assurance pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Department of Life Science — Parul University, Department of Microbiology — Pukyong National University et Korea Environmental Industry and Technology Institute, avec 6 autres affiliations.
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