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Accès ouvert déclaré 2026 preprint

Cryo-EM of a nucleotide-polymerizing ribozyme enables its predictive improvement

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Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Abstract Ribozymes capable of self-replication from nucleotides would have been central to the hypothesized RNA World. The leading laboratory models for such molecules were converted from a class I ligase by in vitro evolution but then developed without 3D structures. Here, scaffolded cryo-EM of the substrate-free tC19Z RNA polymerase ribozyme at 3.1 Å resolution shows how this conversion was achieved. An accessory domain evolved from random sequence grips the ancestral ligase through a loop-loop contact, a seam of magnesium ions, and a six-base stack, and rebuilds the ligase’s substrate binding site from different residues of its own. A previously unrecognized pairing, present before substrate binds, sequesters the 5′ end that must otherwise pair with the template. Compensatory mutations to the ribozyme and template, designed to break this ectopic pairing, increase the extension rate. These results suggest that accelerating RNA structure determination may speed progress toward nucleotide-based self-replication.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Cryo-EM of a nucleotide-polymerizing ribozyme enables its predictive improvement
Date Crossref
17/08/2026
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • Stanford University Department of Biochemistry pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • CAE Solutions (United States) pays non établi dans la notice
    Entreprise
  • Howard Hughes Medical Institute Janelia Research Campus pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • University of California San Diego Department of Chemistry and Biochemistry pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Janelia Research Campus pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Inc. A-Form Solutions pays non établi dans la notice
    Entreprise

Department of Biochemistry — Stanford University, CAE Solutions (United States) et Janelia Research Campus — Howard Hughes Medical Institute, avec 3 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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