Decoding Spatial Programs in Human Glioblastoma Through Surprisal Information-Theoretical Analysis
Rattachement africain : us, be, il. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract Glioblastoma (GBM) is a highly heterogeneous and invasive brain tumor in which complex interactions among tumor cells, immune cells, and neurons shape disease progression and therapeutic resistance. Resolving spatial patterns programs in glioblastoma (GBM) requires analytical approaches that go beyond variance-driven embeddings. Here, we applied thermodynamic surprisal analysis, an information-theoretic decomposition framework, to spatial transcriptomic sequencing from human GBM specimens to identify orthogonal constraint modes that capture dominant and previously hidden spatial programs. Surprisal analysis revealed structured patterns in the data that are not highlighted by standard approaches such as PCA or cell type deconvolution, including immune-activation–associated signatures as well as spatial programs consistent with synapse remodeling. Coupling surprisal decomposition with spatial ligand–receptor interaction analysis, NICHES, along with multiplexed protein imaging connected these spatial hidden modes to reveal potential communication networks. Together, these results position surprisal analysis as a powerful, complementary strategy for interrogating spatial tumor architecture, enabling discovery of non-obvious spatial programs and interactions that are obscured by variance-based methods.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Decoding Spatial Programs in Human Glioblastoma Through Surprisal Information-Theoretical Analysis
- Date Crossref
- 24/06/2026
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Yale University Department of Biomedical Engineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Liège Research Unit Molecular Systems B6c pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Wisconsin–Madison Department of Biostatistics and Medical Informatics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institute for Systems Biology pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Parker Institute for Cancer Immunotherapy pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of California pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hebrew University of Jerusalem The Fritz Haber Research Center for Molecular Dynamics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Los Angeles Medical Center pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Yale Cancer Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Yale School of Medicine Department of Neurosurgery pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institute of Systems Biology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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David Geffen School of Medicine Department of Molecular and Medical Pharmacology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Department of Biomedical Engineering — Yale University, Research Unit Molecular Systems B6c — University of Liège et Department of Biostatistics and Medical Informatics — University of Wisconsin–Madison, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.