Training biologists in Unix command-line skills: From curriculum to interactive online tutorials
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Le résumé fourni par la source
As the generation of data in the life and health sciences expands rapidly, there is a growing need for professionals and students in these fields to master core bioinformatics skills, particularly those relating to Unix-like systems, most commonly used in bioinformatics. This paper introduces two key contributions to address this need: (1) A Unix curriculum for life scientists with little or no command-line experience, based on progressive Unix skill levels for bioinformatics and (2) An implementation of this curriculum into a series of interactive online tutorials deployed through Sandbox.bio-an open-source platform for learning bioinformatics that embeds a command line in the browser, which removes barriers related to software installation and access. We performed an overall evaluation of this teaching framework in different contexts. This inclusive, sustainable approach provides widespread access to essential bioinformatics skills for life science students and professionals alike.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Training biologists in Unix command-line skills: From curriculum to interactive online tutorials
- Date Crossref
- 03/04/2026
- Éditeur
- Public Library of Science (PLoS)
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Inserm pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Commissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Institut National de Recherche pour l'Agriculture pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Institut Français de Bioinformatique IFB-core pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Université Paris-Saclay pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université Paris Cité pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Laboratoire de Biochimie Théorique pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Theories and Approaches of Genomic Complexity pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Université Paris Sciences et Lettres pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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École Normale Supérieure - PSL pays non établi dans la noticeInstitution
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Institut de Biologie de l'École Normale Supérieure pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Centre National de la Recherche Scientifique, Inserm et Commissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives, avec 9 autres affiliations.
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