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broadinstitute/viral-pipelines: v3.0.11.0

Daniel Park, Chris Tomkins-Tinch, Simon Ye, Irwin Jungreis, Flavia, Ilya A. Shlyakhter, Hayden C. Metsky, Sushma Chaluvadi, Lydia Andreyevna Krasilnikova, Juan Pablo Ramos Barroso, Hanna, Mike Lin, Venkat Malladi, Aaron Lin, Vang Le, cmloreth, llangit-broad, Katrin Leinweber, pvanheus

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6Institutions déclarées

5Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : us, ru, jp, de, gb. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

What's Changed bump viral-ngs to 3.0.9 by @dpark01 in https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/pull/649 bump viral-ngs 3.0.10, remove GATK IndelRealigner deps, update lofreq pipeline by @dpark01 in https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/pull/650 fix tar_extract: switch LOCAL to HDD disk, bump cpu and preemptible by @dpark01 in https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/pull/651 Bump docker image versions for ncbi-tools, nextclade, read-qc-tools, pangolin by @dpark01 in https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/pull/652 Adjust preemptible settings for assembly/metagenomics tasks by @dpark01 in https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/pull/654 Add rasusa-based coverage downsampling and tune preemptible settings by @dpark01 in https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/pull/655 Full Changelog: https://github.com/broadinstitute/viral-pipelines/compare/v3.0.8.0...v3.0.11.0

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

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Où se fait cette recherche

Broad Institute pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
Moscow Institute of Thermal Technology pays non établi dans la notice
Structure de recherche
Ltd. (Japan) Merck Biopharma Co. pays non établi dans la notice
Entreprise
Dynavax Technologies (Germany) pays non établi dans la notice
Entreprise
Novo Nordisk (United Kingdom) pays non établi dans la notice
Entreprise
Independent Sector pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
MIT pays non établi dans la notice
Institution
Merck pays non établi dans la notice
Institution
DynoTx pays non établi dans la notice
Institution

Broad Institute, Moscow Institute of Thermal Technology et Merck Biopharma Co. — Ltd. (Japan), avec 6 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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