Chromosome-Level Genome Assembly and Annotation of Piptanthus nepalensis (Hook.) Sweet
Rattachement africain : cn. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Piptanthus nepalensis (Hook.) Sweet is a leguminous shrub native to the Himalayan region and is valued for its medicinal uses and ornamental yellow flowers. Here, we report a chromosome-scale genome assembly of P. nepalensis generated using PacBio HiFi long reads, Illumina short reads, and Hi-C chromatin interaction data. The assembled genome spans approximately 1.04 Gb, with a contig N50 of 39.5 Mb and a scaffold N50 of 111.5 Mb. Benchmarking universal single-copy orthologs (BUSCO) analysis indicated high completeness for both the genome (99.3%) and predicted protein set (99.2%). Approximately 99.0% of the assembled sequences were anchored onto nine pseudo-chromosomes. We annotated 26,035 protein-coding genes, and repetitive elements were estimated to comprise ~75.2% of the genome. This high-quality genome assembly provides a foundational genomic resource for P. nepalensis and supports future studies on its biology and utilization.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Chromosome-Level Genome Assembly and Annotation of Piptanthus nepalensis (Hook.) Sweet
- Date Crossref
- 31/03/2026
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Fudan University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Xizang Minzu University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Tibet University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Life Sciences Ministry of Education Key Laboratory for Biodiversity Science and Ecological Engineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Ecology and Environment Key Laboratory of Biodiversity and Environment on the Qinghai-Tibetan Plateau pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Xizang University Yani Observation and Research Station for Wetland Ecosystem of the Tibet (Xizang) Autonomous Region pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Fudan University, Xizang Minzu University et Tibet University, avec 3 autres affiliations.
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