2025 Ginkgo Datapoints Antibody Developability Competition outcomes: limited model performance and a call for data standardization
Rattachement africain : us, Égypte, gb. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The Ginkgo Datapoints Antibody Developability (AbDev) Competition, a blinded benchmark for developability prediction characterized entirely on a single, industrial-scale experimental platform, was conducted from September 8 to November 18, 2025. We benchmarked predictors across five biophysical properties - hydrophobicity, thermostability, self-association, expression titer, and polyreactivity - using a public training set of 246 clinical antibodies and a blinded, held-out test set of 80 antibodies. We received submissions from 113 teams spanning 25 countries, 38 companies, and 39 universities. Winning submissions differed by assay. Top Spearman's ρ values on the test set reached 0.708 (hydrophobicity), 0.392 (thermostability), 0.356 (polyreactivity), 0.337 (self-association), and 0.310 (titer). Cross-validation scores from the public training set consistently exceeded held-out test performance, indicating overfitting and limited out-of-distribution generalization. Together, these results provide a standardized snapshot of current antibody developability modeling capabilities and highlight a key bottleneck: available datasets are too small and heterogeneous to support robust, assay-spanning prediction. Meaningful progress will require larger, standardized, and diverse experimental datasets - with harmonized protocols and rich metadata - to train and validate models that generalize reliably for future antibody discovery campaigns.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- 2025 Ginkgo Datapoints Antibody Developability Competition outcomes: limited model performance and a call for data standardization
- Date Crossref
- 22/02/2026
- Éditeur
- Informa UK Limited
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Inc. (United States) Ginkgo Bioworks pays non établi dans la noticeEntreprise
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FACE Foundation pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Hugging Face pays non établi dans la noticeEntreprise
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Johns Hopkins University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Boehringer Ingelheim (Egypt) Égypte (code pays fourni par la source)Entreprise
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UCT Coatings (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Harvard University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Duke University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Oxford pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Michigan pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Ginkgo Bioworks Inc pays non établi dans la noticeEntreprise
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X UNFOLD LLC pays non établi dans la noticeInstitution
Ginkgo Bioworks — Inc. (United States), FACE Foundation et Hugging Face, avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Égypte.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.