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Accès ouvert déclaré 2025 preprint

Human acrocentric chromosome short arm de novo mutation and recombination

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6Institutions déclarées
2Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : us, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

ABSTRACT The extraordinary repetitive content of human acrocentric short arms has prevented detailed investigations into recombination and de novo mutation. Integrating multiple sequencing technologies, we created 156 phased short arms and assessed 107 intergenerational transmissions from 23 samples in a four-generation pedigree. We observed a significant depletion ( P <0.0001) of p-arm allelic recombination but one ectopic chr13–chr21 recombination breakpoint mediated by a 630 kbp segmental duplication mapping 1.6 Mbp distal to the SST1 array. In contrast, 18 maternal-biased q-arm allelic recombinations are significantly enriched within 5 Mbp of the centromere. Compared to autosomal euchromatin, the overall p-arm de novo single-nucleotide variant rate (1.33×10⁻⁷ per base pair per generation) is 10-fold higher, with a significant reduction of C>T but increased C>G and A>C mutations. We hypothesize that acrocentric sequence composition biases and the dearth of allelic recombination contribute to an elevated mutation rate and unique mutational signatures suggestive of mismatch repair defects and oxidative stress-induced DNA lesions.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.

Titre Crossref
Human acrocentric chromosome short arm <i>de novo</i> mutation and recombination
Date Crossref
17/12/2025
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • University of Washington Department of Genome Sciences pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • National Institutes of Health pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • National Human Genome Research Institute Center for Genomics and Data Science Research pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • European Molecular Biology Laboratory pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • University of Utah Department of Human Genetics pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Howard Hughes Medical Institute pays non établi dans la notice
    Structure de recherche

Department of Genome Sciences — University of Washington, National Institutes of Health et Center for Genomics and Data Science Research — National Human Genome Research Institute, avec 3 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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