Genomic evidence of positive selection highlights functional divergence associated with environmental resilience in central and West African indigenous cattle
Rattachement africain : it, Éthiopie, Cameroun, de, gb, Kenya. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
African indigenous cattle harbor rich genetic diversity shaped by long-term adaptation to tropical climates and endemic diseases, notably trypanosomiasis. To investigate the genetic basis of natural disease resistance, we analyzed 33,147 SNPs in 1,047 individuals from 17 breeds using complementary selection scans (iHS, XP-EHH, and Rsb) in a multi-cohort framework. Fifteen pairwise comparisons across six breed groups enabled robust detection of recent positive selection, capturing both within-breed and breed-specific adaptive signals. We identified 229 selective regions, with 47 outlier SNPs consistently detected by multiple methods. Selection signals were enriched on chromosomes 5, 7, and 29, containing candidate genes such as ATF4, PKNOX2, DNAJB7, TEF, NFE2, and several SPINK and HOXC family members, many associated with immune function and trypanosome challenge response. These genomic regions represent promising targets for the development of breeding strategies aimed at enhancing disease resilience. By identifying genomic regions under selection, this study provides interesting insights for sustainable livestock improvement and conservation efforts in West and Central Africa. Our findings support the integration of indigenous genetic resources into breeding programs designed to optimize productivity while maintaining resilience to environmental and disease pressures.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Genomic evidence of positive selection highlights functional divergence associated with environmental resilience in central and West African indigenous cattle
- Date Crossref
- 01/12/2025
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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University of Molise Department of Agriculture pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Debre Markos University Debre Markos University, Éthiopie (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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University of Buea University of Buea, Cameroun (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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University of Tübingen Department of Comparative Zoology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Bamenda University of Bamenda, Cameroun (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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University of Hohenheim Institute of Animal Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Nottingham pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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International Livestock Research Institute ILRI - CTLGH Addis Ababa, Kenya (code pays fourni par la source)Structure de recherche
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Bundeswehrkrankenhaus pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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College of Agriculture and Natural resources Department of Plant Science Debre Markos University, Éthiopie (pays nommé en fin d’affiliation)Université ou école supérieure
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Faculty of Agriculture and Veterinary Medicine Department of Veterinary Medicine University of Buea, Cameroun (pays nommé en fin d’affiliation)Université ou école supérieure
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TOZARD research laboratory Bamenda, Cameroun (pays nommé en fin d’affiliation)Structure de recherche
Department of Agriculture — University of Molise, Debre Markos University (Debre Markos University, Éthiopie) et University of Buea (University of Buea, Cameroun), avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Éthiopie, Cameroun, Kenya.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.