Peer Review Report For: flimview : A software framework to handle, visualize and analyze FLIM data [version 1; peer review: 1 approved, 1 approved with reservations]
Rattachement africain : us, fr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
flimview is a bio-imaging Python software package to read, explore, manage and visualize Fluorescence-Lifetime Imaging Microscopy (FLIM) images. It can open the standard FLIM data file conventions (e.g., sdt and ptu) and processes them from the raw format to a more readable and manageable binned and fitted format. It allows customized kernels for binning the data as well as user defined masking operations for pre-processing the images. It also allows customized fluorescence decay fitting functions and preserves all of the metadata generated for provenance and reproducibility. Outcomes from the analysis are lossless compressed and stored in an efficient way providing the necessary open-source tools to access and explore the data. flimview is open source and includes example data, example Jupyter notebooks and tutorial documentation. The package, test data and documentation are available on Github .
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Peer Review Report For: flimview : A software framework to handle, visualize and analyze FLIM data [version 1; peer review: 1 approved, 1 approved with reservations]
- Date Crossref
- 01/09/2020
- Éditeur
- F1000 Research Ltd
- Type
- peer-review
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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University of Illinois Urbana-Champaign pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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National Center for Supercomputing Applications pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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GlaxoSmithKline (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Illinois College pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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GlaxoSmithKline (France) pays non établi dans la noticeEntreprise
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University of Illinois at Urbana-Champaign National Center for Supercomputing Applications pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Collegeville GlaxoSmithKline pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
University of Illinois Urbana-Champaign, National Center for Supercomputing Applications et GlaxoSmithKline (United States), avec 4 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.