Novel insights into the genome organization of Rhizobiaceae: identification of linear plasmids
Rattachement africain : de, au, pl, Nigéria, us, ca. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Members of the family Rhizobiaceae typically have multipartite genomes that are split between two or more replicons, including the chromosome and a variable number of extrachromosomal replicons (chromids and plasmids). Nearly all Rhizobiaceae replicons sequenced and described to date have a circular topology, except the linear chromid found in the genomes of most Agrobacterium spp. In this study, genomes of five non-pathogenic Agrobacterium strains and one plant tumourigenic Allorhizobium strain were fully sequenced. Surprisingly, genome analysis revealed that these six strains each carry an 80-kbp linear plasmid. Linear plasmids have so far not been identified in this bacterial family or other bacteria within the class Alphaproteobacteria . The ends of all six plasmids identified in this study have a hairpin structure with covalently closed ends. The plasmid sequences showed a high degree of homology, clearly indicating their common ancestry. Database searches led to the identification of additional linear plasmids in previously published Rhizobiaceae genome assemblies that were not previously recognized to have linear plasmids, suggesting that these replicons may be more widespread. Most likely, linear plasmids may be even more widely distributed than anticipated. Although the biological functions of the linear plasmids identified in this study remain unknown, they are associated with both non-pathogenic and plant tumourigenic Rhizobiaceae strains.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Novel insights into the genome organization of Rhizobiaceae: identification of linear plasmids
- Date Crossref
- 05/11/2025
- Éditeur
- Microbiology Society
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Julius Kühn-Institut pays non établi dans la noticeOrganisme public
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The University of Melbourne Centre for Pathogen Genomics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Peter Doherty Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Maria Curie-Skłodowska University Department of Genetics and Microbiology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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National Horticultural Research Institute Nigéria (code pays fourni par la source)Structure de recherche
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Horticultural Research Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Instytut Ogrodnictwa – Państwowy Instytut Badawczy pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Queen's University Department of Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Calgary Department of Biological Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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The National Institute of Horticultural Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Julius Kühn-Institut, Centre for Pathogen Genomics — The University of Melbourne et Peter Doherty Institute, avec 7 autres affiliations. Pays d’affiliation : Nigéria.
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