Identifying Bioactive Conformations of Flexible Polyunsaturated Fatty Acids for Ligand-Based Drug Design
Rattachement africain : cn, jp. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Polyunsaturated fatty acids (PUFAs) are signaling molecules exhibiting diverse bioactivities. Due to their flexible nature, PUFAs can theoretically adopt an enormous number of conformations, and it is not easy to identify the biologically active conformation(s), so rational drug design targeting the corresponding receptors is difficult. Here, we established a method to characterize conformational similarity by combining the replica exchange molecular dynamics simulation with the 3-dimensional WHIM (Weighted Holistic Invariant Molecular) descriptor. Using this method, we explored the total conformational space of 6 PUFAs and identified their conformational preferences for binding to known proteins. We found that upon binding, a specific cluster of conformers from the solution state is populated, which can be termed as bioactive conformations. By comparing the dynamics of synthetic modulators with those of PUFAs, we found that these compounds can be regarded as rigid mimics of the bioactive conformations of PUFAs, though this perspective has not been previously described. This approach is expected to be helpful in designing new bioactive molecules.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Identifying Bioactive Conformations of Flexible Polyunsaturated Fatty Acids for Ligand-Based Drug Design
- Date Crossref
- 25/10/2025
- Éditeur
- Pharmaceutical Society of Japan
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Southern Medical University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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The University of Tokyo pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Niigata University of Pharmacy and Medical and Life Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Graduate School of Pharmaceutical Sciences Laboratory of Organic and Medicinal Chemistry pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Traditional Chinese Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Faculty of Pharmacy pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Southern Medical University, The University of Tokyo et Niigata University of Pharmacy and Medical and Life Sciences, avec 3 autres affiliations.
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