Genetic architecture of cowpea domestication: QTL mapping and comparison shed new light on the dual domestication events
Rattachement africain : Sénégal, fr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Understanding the genetic basis of domestication-related traits (DRTs) is crucial for crop improvement. In this study, we developed an interspecific backcross population by crossing the elite cowpea variety Sam with a wild accession of Vigna unguiculata var. spontanea from Senegal. Using a mid-density single nucleotide polymorphism panel, we constructed a high-quality genetic linkage map consisting of 1,046 polymorphic markers spanning 1,131.6 cM across 11 chromosomes and used it as a framework for dissecting the genetic architecture of key DRTs. Over 2 consecutive years, we identified 65 quantitative trait loci (QTLs) associated with 17 key domestication traits, with 73.8% of these QTLs consistently detected across both years. Notably, we observed a significant clustering of domestication-related QTLs within 4 major genomic regions on chromosomes Vu01, Vu03, Vu08, and Vu09, particularly for organ size and phenological traits. The co-location of QTLs for traits such as pod shattering, growth habit, and flowering time suggests pleiotropy or potential co-selection of linked genes during domestication. Furthermore, our findings support the hypothesis of 2 independent domestication events in cowpea, as evidenced by similarities as well as differences in QTL regions between our study and previous reports. We hypothesized that common as well as different loci may have been selected during the 2 independent domestication events of cowpea, paralleling the dual domestication in common beans. While wild cowpea species contributed limited major-effect QTLs for yield-related traits, they remain an essential reservoir of genetic diversity, particularly for pest and disease resistance. These insights enhance our understanding of cowpea domestication and offer valuable genetic resources for breeding programs.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Genetic architecture of cowpea domestication: QTL mapping and comparison shed new light on the dual domestication events
- Date Crossref
- 17/10/2025
- Éditeur
- Oxford University Press (OUP)
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Centre d'Etude Regional pour l'Amelioration de l'Adaptation a la Secheresse BP3320 Thiès, Sénégal (code pays fourni par la source)Structure de recherche
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Institut Sénégalais de Recherches Agricoles Sénégal (code pays fourni par la source)Structure de recherche
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Cheikh Anta Diop University Sénégal (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institut Agro Montpellier pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institut National de Recherche pour l'Agriculture pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et tropicales pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institut Agro Montpelier pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Services déconcentrés d'appui à la recherche Occitanie-Montpellier pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Faculté des Sciences et Techniques Laboratoire Campus de Biotechnologies Végétales Dakar-Fann, Sénégal (ville ou établissement reconnu, pays non nommé)Université ou école supérieure
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University Montpellier CIRAD pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Centre de Recherches Agronomiques (CNRA) de Bambey Bambey, Sénégal (ville ou établissement reconnu, pays non nommé)Structure de recherche
Centre d'Etude Regional pour l'Amelioration de l'Adaptation a la Secheresse (BP3320 Thiès, Sénégal), Institut Sénégalais de Recherches Agricoles (Sénégal) et Cheikh Anta Diop University (Sénégal), avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Sénégal.
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