Accès ouvert déclaré 2025 preprint

Extracting the Research Goal from Biomedical Abstracts

Mariana Neves, Ines Schadock, Daniel Butzke, Gilbert Schönfelder, Bettina Bert

0Citations signalées, ce qui n’est pas une note de qualité

2Institutions déclarées

1Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Abstract Extracting the research goal of a publication can potentially support researchers when searching the biomedical literature. Systems can make use of this information for various tasks, e.g., query processing or matching and ranking the candidates. However, this is a very subjective and complex task, which might involve various semantic types and may vary depending on the research area. Previous work have ventured in this area, but as far as we know, no specific dataset is yet available. We reused seven reviews from the European Commission with annotations about the research goal for more than 2.8k articles. We compiled the RG4C dataset, which we then used to fine tune a model for the automatic extraction of four criteria: “Field of Application”, “Disease Area”, “Disease Feature”, and “Biological Endpoint”. We obtained an overall f-score of 0.59, with results for each criterion ranging from 0.35 to 0.83. The RG4C dataset is available at: https://www.kaggle.com/datasets/marianaln/eu-qa-complete . Our source code is available at: https://www.kaggle.com/code/marianaln/eu-qa-features/notebook

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref: Extracting the Research Goal from Biomedical Abstracts
Date Crossref: 21/09/2025
Éditeur: openRxiv
Type: posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

Federal Institute for Risk Assessment pays non établi dans la notice
Organisme public
Charité - Universitätsmedizin Berlin pays non établi dans la notice
Établissement de santé
German Centre for the Protection of Laboratory Animals (Bf3R) pays non établi dans la notice
Structure de recherche
Institute of Clinical Pharmacology and Toxicology pays non établi dans la notice
Structure de recherche

Federal Institute for Risk Assessment, Charité - Universitätsmedizin Berlin et German Centre for the Protection of Laboratory Animals (Bf3R), avec 1 autre affiliation.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

Biomedical Text Mining and OntologiesScientific Computing and Data ManagementTopic Modeling

Lire en accès ouvert Consulter la publication primaire Ouvrir le DOI