Long-read sequencing reveals the RNA isoform repertoire of neuropsychiatric risk genes in human brain
Rattachement africain : au, se. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
BACKGROUND: Neuropsychiatric disorders are highly complex conditions and the risk of developing a disorder has been tied to hundreds of genomic variants that alter the expression and/or RNA isoforms made by risk genes. However, how these genes contribute to disease risk and onset through altered expression and RNA splicing is not well understood. RESULTS: Combining our new bioinformatic pipeline IsoLamp with nanopore long-read amplicon sequencing, we deeply profile the RNA isoform repertoire of 31 high-confidence neuropsychiatric disorder risk genes in Human brain. We show most risk genes are more complex than previously reported, identifying 363 novel isoforms and 28 novel exons, including isoforms which alter protein domains, and genes such as ATG13 and GATAD2A where most expression was from previously undiscovered isoforms. The greatest isoform diversity is detected in the schizophrenia risk gene ITIH4. Mass spectrometry of brain protein isolates confirms translation of a novel exon skipping event in ITIH4, suggesting a new regulatory mechanism for this gene in the brain. CONCLUSIONS: Our results emphasize the widespread presence of previously undetected RNA and protein isoforms in the human brain and provide an effective approach to address this knowledge gap. Uncovering the isoform repertoire of candidate neuropsychiatric risk genes will underpin future analyses of the functional impact these isoforms have on neuropsychiatric disorders, enabling the translation of genomic findings into a pathophysiological understanding of disease.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Long-read sequencing reveals the RNA isoform repertoire of neuropsychiatric risk genes in human brain
- Date Crossref
- 23/09/2025
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
The University of Melbourne Department of Anatomy and Physiology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Science for Life Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
KTH Royal Institute of Technology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
Melbourne Genomics Health Alliance pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
Florey Institute of Neuroscience and Mental Health pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Alfred Health pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
School of Mathematics and Statistics/Melbourne Integrative Genomics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Department of Anatomical Pathology pays non établi dans la noticeInstitution
-
Victorian Brain Bank pays non établi dans la noticeInstitution
Department of Anatomy and Physiology — The University of Melbourne, Science for Life Laboratory et KTH Royal Institute of Technology, avec 7 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.